农业生物技术学报

作者：裴栋超, 海超, 赵春生, 张立果, 吴迪, 王德政, 张鑫怡, 杨磊, 李光鹏

单位：内蒙古大学 省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室,呼和浩特 010070

关键词：肌肉生长抑制素(MSTN),蒙古牛,基因突变,基因型检测,

基金：科技创新2030–重大项目(2023ZD0404803); 国家自然科学基金(32360837; 32341052); 内蒙古科技领军团队(2022LJRC0006); 农业农村部农业重大科技项目(NK202213020303); 内蒙古揭榜挂帅项目(2022JBGS0025); 内蒙古科技重大专项(2021ZD0009; 2021ZD0008; 2022ZD0008); 内蒙古科技计划(2023KJHZ0028); 内蒙古青年科技英才项目(NJYT23138); 中央引导地方科

肌肉生长抑制素(myostatin, MSTN)是骨骼肌生长发育的负调控因子,MSTN基因突变可促进动物肌肉发育。目前Sanger测序是检测MSTN基因突变的经典方法,但此方法存在检测通量低、可视化程度低和检测费用高等缺点。本研究利用二代测序技术,通过设计的特异性Barcode序列,能够一次性检测96头牛(Bos taurus)的 MSTN基因突变情况。此外,根据测序Fastq结果文件中的Barcode序列,利用异步线程和并发算法,编写了相关的数据分析DAVID (detect and visualize insertion-deletion)软件。利用DAVID软件将96个混合样本的测序数据逐一拆分,并与扩增子序列(amplicon sequence)比对,最终获得MSTN基因突变的图形和统计信息。利用DAVID技术对96头蒙古牛进行检测,结果发现1头牛的MSTN基因11 bp杂合缺失,剩余95头均为野生型,并且通过Sanger测序对11 bp杂合缺失进行了验证。综上,本研究构建了一个检测牛MSTN基因突变的高通量技术体系,为肉牛遗传改良和育种提供技术支撑。

来源：2025年第1期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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