国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:石琳, 郭子玄, 李小伟, 马士龙, 何小强, 江明锋, 刘益丽
单位:1 西南民族大学 畜牧兽医学院, 成都 610041; 2 四川省龙日种畜场, 红原 624400
关键词:牦牛,突触融合蛋白17 (STX17),毛色,生物信息学分析,组织特异性表达,
基金:那曲市科技局重点研发计划项目(NQKJ-2023-07);西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金(ZYN2024062);四川省区域创新合作项目(2023YFQ0076)
麦洼牦牛(Bos grunniens)是青藏高原型牦牛的地方良种,前期研究表明,麦洼牦牛的毛色与其生产性能相关,可作为育种依据,其灰毛性状与突触融合蛋白17 (syntaxin-17, STX17)基因的表达水平相关,STX17蛋白参与溶酶体和自噬体融合过程,在黑色素的合成、运输及黑色素瘤的生成中起重要作用。为研究STX17基因与麦洼牦牛毛色形成的相关性,本研究选取3岁龄的健康成年雄性黑色和灰色麦洼牦牛各3头,以其心、脾、肺、肾和皮肤组织作为实验材料,通过PCR克隆STX17基因编码区序列,利用在线软件对其进行生物信息学分析,用qRT-PCR技术检测STX17基因在麦洼牦牛不同组织及不同毛色种群中的表达情况。结果表明,麦洼牦牛STX17基因CDS区全长909 bp,编码的蛋白质含302个氨基酸,等电点(pI)理论值为5.82,为酸性蛋白;STX17蛋白无信号肽序列,存在1个靶膜相关的可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors, SNARE) 结构域和2个串联的跨膜结构域;亚细胞定位预测STX17蛋白主要存在于细胞质中;核苷酸序列比对显示,麦洼牦牛STX17基因与黄牛(Bos taurus)亲缘性最近,其次是水牛(Bubalis bubalus);STX17蛋白与自噬相关蛋白14 (autophagy-related protein 14, ATG14)、突触体相关蛋白29 (synaptosome associated protein of 29, SNAP29)、囊泡相关膜蛋白7 (vesicle associated membrane protein 7, VAMP7)、囊泡相关膜蛋白8 (vesicle associated membrane protein 8, VAMP8)和突触素同源物(synaptobrevin homolog, YKT6)等蛋白存在相互作用;qRT-PCR结果显示,STX17基因在皮肤组织中表达量最高,且在灰毛麦洼牦牛皮肤中的表达量高于黑毛麦洼牦牛,推测STX17基因与麦洼牦牛灰色和黑色毛色的形成有关。本研究为后续麦洼牦牛毛色的调控机制等研究提供理论依据。
来源:2025年第4期
《农业生物技术学报》期刊编辑部