农业生物技术学报

作者：赵中龙, 冉光友, 张勇, 张习本, 王智伟, 艾照碧, 杨润黔, 李未博, 陈泽林, 叶红英

单位：1 贵州大学 动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵阳 550025; 2 毕节市农业科学院, 毕节 551700

关键词：威宁鸡(Gallus gallus),蛋白磷酸酶3催化亚基α,(PPP3CA)基因,单核苷酸多态性(SNP),生长性状,关联分析,

基金：2024年贵州省生态家禽产业技术体系建设任务书项目(GZSTJQCYJSTX-07);毕节市2023年度粤黔东西部协作资金项目;毕节市农业科技计划项目(毕科合[2023]13号);毕节地方优质鸡产业技术创新人才团队建设项目(毕委人领办通[2023]14号)

威宁鸡(Gallusgallus)是贵州省地方珍贵家禽种质资源之一。利用候选基因研究威宁鸡生长性状并揭示遗传效应,对威宁鸡遗传改良及分子标记育种具有重要意义。本研究以113只(公58只,母55只)300日龄的威宁鸡为研究对象,采用PCR扩增和直接测序技术鉴定蛋白磷酸酶3催化亚基α(proteinphosphatase3catalyticsubunitα,PPP3CA)基因的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)位点,利用Excel统计各位点基因型频率、等位基因频率、有效等位基因数、多态信息含量,并分析各突变位点是否处于Hardy-Weinberg平衡状态;通过在线软件RNAfold进行mRNAs二级结构分析;利用SPSS27.0软件对具有多态性位点的基因型与体尺性状进行关联分析。研究表明,威宁鸡PPP3CA基因外显子6上存在3个SNP位点,即g.151368C>T、g.151389T>C和g.151402T>G,其中g.151368C>T位点发生错义突变导致206位精氨酸变为色氨酸,g.151402T>G位点错义突变导致216位异亮氨酸变为色氨酸。连锁不平衡分析发现,g.151389T>C和g.151368C>T、g.151402T>G位点间存在较强连锁不平衡效应;χ2检验表明,g.151368C>T和g.151389T>C位点符合Hardy-Weinberg平衡,而g.151402T>G位点偏离Hardy-Weinberg平衡。关联性分析发现,g.151402T>G位点TT、GG型个体的体重、体斜长和胸宽显著高于TG个体(P<0.05),TT型个体的胸深显著高于GG、TG型个体(P<0.05),GG型个体的胸深显著高于TG型个体(P<0.05),TT、GG型个体的龙骨长和胫长极显著高于TG型个体(P<0.01);TT、GG型个体胫围显著高于TG型个体(P<0.05)。对3个SNPs位点进行单倍型和双倍型分析,发现共存在4种单倍型和8种双倍型,其中,双倍型H2H3(TCTCTT)和H1H1(TTCCGG)可作为提高龙骨长、胫长、胫围的候选分子标记位点。本研究为威宁鸡生长性状分子标记辅助选择提供了科学依据。

来源：2025年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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