农业生物技术学报

作者：阎卉萱, 姚婷婷, 曹一凡, 李心怡, 次仁罗布, 索朗曲吉, 尼玛仓决, 旦增洛桑, 斯朗旺姆, 雷初朝, 巴桑珠扎, 陈宁博

单位：1 西北农林科技大学 动物科技学院/陕西省动物遗传育种与繁殖重点实验室,杨凌 712100; 2 西藏自治区农科院 畜牧兽医研究所,拉萨 850000

关键词：青藏高原黄牛,Y染色体单核苷酸多态性(Y-SNPs),Y染色体插入和缺失(Y-INDELs),单倍型,父系起源,

基金：国家自然科学基金(32102523; 32260823); 西藏自治区重点研究发展计划项目(XZ202301ZY0008N)

青藏高原黄牛(Bos taurus)因其独特的地理环境及丰富的品种多样性,是中国高原地区珍稀的地方黄牛种质资源。为分析青藏高原黄牛的父系遗传多样性和系统发育关系,本研究整合了77头青藏高原公牛的全基因组重测序数据,对其Y染色体基因组X退化区单拷贝基因区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)和插入/缺失(insertion and deletion, INDEL)位点进行扫描。结果表明,共鉴定到2 672个Y染色体单核苷酸多态性(Y-SNPs)和712个Y染色体插入和缺失(Y-INDELs)位点。基于Y-SNPs,本研究定义了30种青藏高原黄牛Y-SNPs单倍型,其中hap10为优势单倍型,占16.88%,发现青藏高原黄牛属于6种Y-SNPs单倍型组/亚单倍型组(Y1, Y2A, Y2B, Y3A2, Y3B1和Y3B4),其中Y2B (59.74%)为主要单倍型组;基于Y-INDELs的分析也呈现一致的结果。青藏高原黄牛群体的Y-SNPs单倍型多样度为0.973±0.006,核苷酸多样度为0.237±0.046。本研究证实青藏高原黄牛拥有6个父系起源,包括3个普通牛(B. taurus taurus)和3个瘤牛(B. taurus indicus)父系起源,拥有较高的父系遗传多样性。本研究为保护和开发利用青藏高原黄牛种质资源提供理论依据。

来源：2025年第8期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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