农业生物技术学报

作者：王章, 朱伟娟, 刘洪, 唐程林, 刘志刚, 曹建萌, 王淼, 衣萌萌, 卢迈新, 可小丽

单位：1 中国水产科学研究院 珠江水产研究所/农业农村部 热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室/广东省水产动物免疫技术重点实验室,广州 510380;2 上海海洋大学 水产与生命学院,上海 201306

关键词：罗非鱼,链球菌病,抗病性,分子标记,竞争性等位基因特异性PCR (KASP),

基金：现代农业产业技术体系专项资金(CARS-46); 国家自然科学基金(32102834); 广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515010852); 2022年水产种业体系建设—罗非鱼“育繁推”一体化育种科企联合体(粤财农〔2022〕119号)

罗非鱼(Oreochromis spp.)对链球菌病的易感性是阻碍罗非鱼养殖健康发展的重要产业问题,然而,关于罗非鱼对链球菌病的抗性机制及其相关分子标记的研究仍然相对有限。本研究以抗性和敏感表型为基础,鉴定罗非鱼抗无乳链球菌病的相关分子标记。通过无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)人工攻毒,根据攻毒后鱼体的存活和死亡情况,筛选尼罗罗非鱼(O. niloticus)群体中对无乳链球菌表现出抗性或敏感的个体。同时,对敏感和抗性个体进行基因组重测序,并以抗性和敏感为表型进行全基因组关联分析(genome-wide association analysis, GWAS)。结果表明,在该群体中,共获得9个与罗非鱼无乳链球菌病抗性相关的大效应分子标记(P<2.50×10-6),以及787个小效应分子标记(2.50×10-6<P<1.00×10-4)。这些大效应分子标记主要定位在罗非鱼连锁群13 (linkage group 13, LG13)、LG17和LG22,并注释到与肿瘤免疫微环境和免疫细胞浸润有关的基因(如WD重复域 27 (WD repeat domain 27, WDR27), 血小板反应蛋白2 (thrombospondins 2, THBS2), XIX型胶原蛋白α-1链(collagen type XIX α-1 chain, COL19A1))以及与先天性免疫相关的基因(如F10 α链(class Ⅰ histocompatibility antigen, F10 α chain-like))。同时,GO和KEGG分析表明,小效应标记注释的基因富集于免疫和炎性通路,包括尿激酶型纤溶酶原激活剂信号通路、Ras信号通路、氰氨基酸代谢、花生四烯酸代谢和牛磺酸代谢。此外,基于竞争性等位基因特异性PCR (kompetitive allele specific PCR, KASP)验证发现,LG13_20881657的GG基因型和LG13_20548718的TT基因型是罗非鱼无乳链球菌病抗性相关的优势基因型。综上,本研究初步揭示了罗非鱼无乳链球菌病抗性相关的基因和分子标记,为抗链球菌病罗非鱼的分子标记辅助选育提供了科学依据。

来源：2025年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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