农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2025年第10期:缢蛏Rh基因家族的鉴定、功能分析及其与氨氮耐受性相关SNPs位点筛选

发布日期:

作者:赖聪颖, 刘耔岱, 董迎辉, 吕丽媛, 林志华

单位:1 浙江万里学院,生物与环境学院/浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室,宁波 315100;2 浙江万里学院 宁海海洋生物种业研究院,宁海 315604;3 浙江万里学院 现代农学院,宁波 315101

关键词:缢蛏,Rh基因,氨转运蛋白基因家族,基因表达,SNPs,

基金:国家自然科学基金(32202918); 国家自然科学基金区域创新发展联合基金(U23A20247); 浙江省水产新品种选育重大科技专项课题(2021C02069-7); 国家现代农业产业技术体系(CARS-49); 浙江省一流学科“生物工程”学生创新项目(CX2024016)

恒河猴蛋白(rhesus proteins, Rh)是氨转运蛋白基因家族的成员,对动物氨的排泄具有重要作用。缢蛏(Sinonovacula constricta)作为围塘混养模式中的主要经济贝类,典型的埋栖行为导致其面临严峻的高氨氮环境。本研究通过生物信息学方法对缢蛏Rh基因家族进行全基因组水平的鉴定,分析其在氨氮胁迫下的表达模式,并研究了其基因功能及与氨氮耐受性的相关性。结果显示,在缢蛏全基因组水平上共鉴定出2个Rh基因家族成员(Sco-Rhbg-1和Sco-Rhbg-2),二者之间同源性为57.96%。组织表达结果显示,Sco-Rhs在鳃中特异性高表达(P<0.01),在氨氮胁迫后,2个Sco-Rhs基因的表达模式存在一定差异。随着胁迫时间的增加,Sco-Rhbg-2基因表达量先下调后升高,最后趋近于初始水平,而Sco-Rhbg-1基因呈下调趋势,且具有更强烈的响应。异源酵母互补实验结果显示,Sco-Rhbg-1蛋白是一个有功能的氨转运蛋白,并且其转运NH4+的能力不受外界pH的影响。同时在Sco-Rhbg-1基因CDS区中鉴定出15个与缢蛏氨氮耐受性相关的SNPs位点。本研究表明,Sco-Rhbg-1基因在氨氮胁迫中具有重要的调节作用,可为后续深入探究Sco-Rhs在高氨氮适应中的分子调控及分子标记辅助育种提供重要的理论基础。

来源:2025年第10期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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