国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:王佳靓, 李正阳, 周扬颜, 季兴龙, 赵强
单位:1 青岛农业大学 园艺学院,青岛 266109;2 山东大丰园农业有限公司,日照 262305
关键词:蓝莓,呼吸爆发氧化酶(RBOH)基因家族,生物信息学分析,器官表达模式,炭疽病,灰霉病,
基金:山东省重点研发计划-农业良种工程(2024LZGCQY025); 山东省现代农业产业体系建设项目(SDAIT-06-05)
呼吸爆发氧化酶(respiratory burst oxidase homolog, RBOH)基因家族在植物生长发育及逆境响应中具有重要作用,但其在蓝莓(Vaccinium spp.)中的成员特征及功能尚不明确。本研究旨在对蓝莓基因组中RBOH基因家族成员进行鉴定和表达模式分析,为揭示蓝莓抗逆机制及分子育种提供参考。基于蓝莓全基因组数据,通过生物信息学方法,鉴定RBOH家族成员,对各成员编码蛋白理化性质、基因结构、进化关系、启动子顺式作用元件以及表达模式等进行分析。结果表明,在蓝莓中共鉴定到16个VcRBOH基因,均含有保守的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate, NADPH)氧化酶结构域,分布在13条不同的染色体上,进化树分析可将16个VcRBOH基因分为3个亚族;基因家族成员共线性分析结果表明,VcRBOH基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)存在密切亲缘关系,且有18对共线性关系;启动子作用元件分析发现,VcRBOH家族基因启动子上含有丰富的激素响应、胁迫响应和生长发育相关响应等元件;转录组数据和荧光定量PCR分析结果表明,VcRBOHs在不同蓝莓品种中的组织表达模式有一定差异,其中VcRBOHA、VcRBOHB、VcRBOHC、VcRBOHD、VcRBOHJ、VcRBOHK和VcRBOHL基因在蓝莓各个器官中都有表达,并且受炭疽病菌(Colletotrichum spp.)和灰霉病菌(Botrytis cinerea)等胁迫的诱导。本研究为后续基因抗病功能解析及蓝莓抗性品种选育提供理论依据。
来源:2025年第12期
《农业生物技术学报》期刊编辑部