国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:李慧, 张雨峰, 李晓刚, 王中华, 常有宏, 蔺经
单位:1 江苏省农业科学院 果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,南京 210014; 2 南京林业大学 生物与环境学院,南京 210037
关键词:杜梨,盐胁迫,转录组,MYB转录因子,表达模式,
基金:国家自然科学基金面上项目(31772287); 江苏省自然科学基金(BK20191238); 江苏省种业振兴揭榜挂帅项目【JBGS〔2021〕084】; 江苏现代农业产业技术体系建设项目【JATS[2022]438】
MYB (myeloblastosis)蛋白是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与植物逆境胁迫应答。到目前为止,对于同一物种不同耐盐能力生态型之间MYB家族的表达模式还没有系统的比较分析。本研究基于杜梨(Pyrus betulaefolia)耐盐单株和普通单株转录组测序(RNA-sequencing, RNA-Seq)数据,筛选鉴定杜梨盐胁迫前后差异表达MYB基因,进行保守结构域归类、染色体分布分析、亚细胞定位预测和系统进化树构建,检测盐胁迫后PbMYBs基因在杜梨不同耐盐性株系各器官中的表达情况。借助转录组分析工具,注释获得129个盐胁迫后差异表达的杜梨PbMYBs基因,根据其结构特性可分为3大类:1R-MYB、R2R3-MYB和3R-MYB。杜梨15号染色体上分布的PbMYBs基因数目最多。构建系统进化树发现,杜梨MYB家族包括3个大类、23个亚类。亚细胞定位预测结果显示,42个PbMYBs转录因子定位于胞外,87个定位于细胞核中。基于转录组数据的基因表达模式分析表明,杜梨PbMYBs基因参与了不同器官应对盐胁迫的转录调控;荧光定量PCR证实,不同PbMYBs转录因子基因分别在杜梨根、茎或叶中受盐胁迫信号诱导表达水平上调或下调。上述结果为进一步研究杜梨MYB家族的基因结构和生物学功能提供相关资料。
来源:2024年第1期
《农业生物技术学报》期刊编辑部