农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第1期:转录因子NAC62在工业大麻中的克隆、生信分析及其干旱胁迫响应分析

发布日期:

作者:杨宇蕾, 张涵雪, 王珊珊, 汤开磊, 杜光辉

单位:云南大学 农学院,昆明 650500

关键词:工业大麻,NAC转录因子,干旱胁迫,生物信息学分析,表达模式,

基金:国家自然科学基金(32160514); 国家麻类产业技术体系建设专项(CARS-16-E15)

工业大麻(Cannabis sativa)是一种重要经济作物,其种子萌发阶段易遭受干旱胁迫,最终对生长和产量造成不利影响。NAC基因是植物中特有的一类转录因子,在植物应对非生物胁迫方面起着重要作用。本研究基于前期的转录组数据,利用RT-PCR方法,从工业大麻品种'云麻1号'中分离克隆出了1个NAC类基因,命名为CsNAC62 (GenBank No. XM_030652694)。序列分析发现,CsNAC62基因CDS大小为1 260 bp,编码419个氨基酸,蛋白质分子量48.32 kD,等电点为8.24。CsNAC62蛋白的N端含有150~160个氨基酸组成的NAC结构域,该结构域由5个亚结构域组成,是NAM/NAC类基因家族典型的保守结构域。蛋白二级结构预测表明,CsNAC62由25.19%的α-螺旋、17.29%的延伸链和57.52%的不规则卷曲组成。系统进化分析表明,工业大麻CsNAC62与桃树(Prunus persica) NAC3的关系最近。'云麻1号'萌发种子中的CsNAC62基因随着干旱胁迫处理(PEG-6000模拟)时间的延长,其表达量也逐步增加,萌发7 d时表达量达到最大。而在正常萌发的种子(对照)中,CsNAC62的表达量则上升缓慢,表明CsNAC62基因受干旱诱导表达。本研究初步揭示了CsNAC62基因在PEG模拟干旱胁迫下的表达模式,为进一步探究其参与工业大麻干旱胁迫响应的分子机制提供参考。

来源:2024年第1期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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