农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第2期:陆地棉磷脂酶C基因家族的鉴定及其在棉纤维发育过程中的表达分析

发布日期:

作者:窦玲玲, 牛换换, 郑凯

单位:1 咸阳师范学院 化学与化工学院,咸阳 712000;2 新疆农业大学 农学院,乌鲁木齐 830000

关键词:陆地棉,PLC基因家族,进化分析,启动子,表达分析,

基金:陕西省教育厅专项科研计划(22JK0602; 20JK0973); 陕西省大学生创新创业训练计划(S202310722092); 安徽荃银高科种业股份有限公司资助(GMLM2023-09)

磷脂酶C (phospholipase C, PLC)是参与磷脂酰肌醇4,5-二磷酸水解的酶,其下游产物介导Ca2+和蛋白激酶C的信号转导。本研究利用磷脂酶C的隐马尔可夫模型(PF09279和PF04185)从陆地棉 (Gossypium hirsutum) '农大棉8号' (NDM8)基因组中鉴定到28个GhPLC基因家族成员。蛋白质序列系统发育分析将GhPLC家族成员分为PIPLC (16个)和nPLC (12个)两大亚组;基因复制分析显示,50%的GhPIPLC和92%的GhnPLC基因起源于片段重复,且受到纯化选择;GhPLC家族基因上游2 000 bp序列启动子顺式作用元件分析显示,所有的GhPLC基因启动子均含有应答植物激素或非生物胁迫的顺式作用元件,表明其可能被植物激素或非生物胁迫诱导表达;qPCR结果显示,15个含有响应赤霉素的顺式作用元件的GhPLC基因中的14个可以被赤霉素诱导上调表达;含有响应生长素的顺式作用元件的15个GhPLC基因中的14个可以被生长素类似物诱导上调表达;25个GhPLC家族基因在棉纤维起始和伸长阶段上调表达,占GhPLC基因家族成员的89%。本研究为后续深入研究GhPLC基因在棉纤维起始和伸长过程中的功能提供了参考。

来源:2024年第2期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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