农业生物技术学报

作者：车卓, 王鹏, 田甜, 张沛沛, 陈涛, 刘媛, 杨德龙

单位：1 甘肃农业大学 生命科学技术学院,兰州 730070;2 甘肃省种子总站,兰州 730070;3 省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,兰州 730070

关键词：小麦,株高,SNP,全基因组关联分析(GWAS),候选基因,

基金：甘肃省农业重点研发计划(21YF5NA089); 中央引导地方科技发展资金(23ZYQA0322); 甘肃省高等学校产业支撑计划(2022CYZC-44); 甘肃省自然科学基金(21JR7RA828); 甘肃省高等学校创新基金(2021B-125)

株高(plant height, PH)是小麦(Triticum aestivum)重要的农艺性状之一,与小麦产量高度相关。为进一步解析小麦株高的遗传基础,本研究对4个环境条件下132份小麦品种(系)株高进行测定,利用小麦35K单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)芯片,基于混合线性模型(mixed linear model, MLM)进行株高的全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。研究结果显示,小麦株高表型变异受环境影响显著,与环境呈显著相关,广义遗传力(h2B)为0.60。本研究共检测到22个与株高显著关联SNP位点(P≤0.001),其中7个SNP位点在2~3个环境条件下同时被检测到,属于稳定关联SNP位点,主要分布于1A、1B、1D、2D和4A染色体上,每条染色体检测到1~3个稳定关联SNP位点,单个稳定关联SNP位点可解释株高9.15%~15.07%的表型变异。4个稳定关联SNP位点与已报道株高QTL存在重叠,其余3个稳定关联SNP位点可能为新的位点。通过对稳定关联位点上下游1 Mb区间内的265个基因进行水稻(Oryza sativa)同源功能分析,筛选得到7个可能影响株高发育的候选基因。本研究可为小麦株高改良提供新的标记和基因资源。

来源：2024年第2期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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