农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第4期:香苏杂交猪ARHGAP24基因SNP检测及生长性状关联分析

发布日期:

作者:蒋传美, 阮涌, 李吉凤, 肖美美, 许家利, 黄家锦, 许厚强

单位:贵州大学 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室/动物科学学院,贵阳 550025

关键词:香苏杂交猪,RhoGTP酶激活蛋白24 (ARHGAP24),生长性状,关联分析,

基金:贵州省科技计划项目[黔科合服企〔2018〕4007(002)号]; 贵州省农业重大产业科学研究攻关项目(黔教合KY字〔2019〕011号)

RhoGTP酶激活蛋白24 (Rho GTPase activating protein 24, ARHGAP24)基因与肌动蛋白重塑、细胞极性控制和细胞迁移密切相关,本研究旨在探究ARHGAP24基因多态性与香苏杂交猪(Sus scrofa)生长性状的关系,以便为后期继续研究香苏杂交猪分子选育工作提供理论参考。本研究采集164头相同饲养条件下的香苏杂交猪血液DNA,通过PCR扩增、测序,确定ARHGAP24基因SNP位点。利用SPSS 25.0软件中的一般线性模型对ARHGAP24基因SNP位点与香苏杂交猪生长性状进行关联分析。结果显示,在香苏杂交猪9个外显子中共检测出5个SNP位点,分别位于外显子1和外显子8。g.735024 A>G非同义突变导致mRNA上第455位缬氨酸变为天冬氨酸,对mRNA结构影响不明显,但导致蛋白质二级结构中α-螺旋以及无规则卷曲所占百分比上升,β-转角和延伸链降低;g.735242 A>C位点非同义突变后导致第528位缬氨酸变为丝氨酸,从而导致mRNA结构产生明显变化,而对蛋白质的二级结构影响则不明显,只是使各结构所占比例发生了轻微的波动。关联结果分析显示,g.735313 C>T位点对胸围有极显著影响(P<0.01),对腹围有显著影响(P<0.05)。对5个SNPs位点进行连锁不平衡分析,共检测到5种单倍型,15种双倍型。香苏杂交猪ARHGAP24基因中g.735313 C>T位点与香苏杂交猪胸围和腹围均存在显著关联,呈中度多态且处于Hardy-Weinberg平衡状态,可作为后期香苏杂交猪遗传标记分子育种候选位点。

来源:2024年第4期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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