农业生物技术学报

作者：白洋洋, 杜书增, 李信, 朱海鲸, 屈雷, 郭振刚, 杨青, 蓝贤勇

单位：1 西北农林科技大学 动物科技学院,杨凌 712000; 2 天津大学 医学工程与转化医学研究院,天津 300072; 3 南阳农业职业学院,南阳 473000; 4 榆林学院 陕西省绒山羊工程技术研究中心,榆林 719000; 5 贵州省毕节市畜牧兽医科学研究所,毕节 551700

关键词：山羊,蛋白磷酸酶3催化亚基&alpha,(PPP3CA),生长性状,拷贝数变异,

基金：十四五国家重点研发计划(2022YFF1000100)

蛋白磷酸酶3催化亚基α (protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha, PPP3CA)在动物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究旨在探究PPP3CA基因在山羊(Capra hircus)不同组织中的表达、拷贝数变异及其对不同品种山羊生长性状的遗传效应。收集11只陕北白绒山羊的心、肝、脾、肺、肾、肌肉、大脑、卵巢、输卵管和睾丸组织,检测PPP3CA基因在不同组织中mRNA的表达水平。在306只陕北白绒山羊和110只贵州黑马羊群体中,利用qPCR技术,检测不同品种山羊PPP3CA基因存在的拷贝数变异(copy number variation, CNV),采用单因素方差分析PPP3CA基因CNV位点与山羊生长性状之间的关联性,并利用生物信息学对CNV位点进行连锁不平衡分析及转录因子预测。结果表明,PPP3CA基因mRNA在肺中表达量最高,脾、输卵管、睾丸、心、肝、肾、肌肉和大脑等组织中表达次之。PPP3CA基因中共检测到3个CNV位点。在陕北白绒山羊群体中CNV1和CNV2位点与山羊的胸围性状显著相关(P<0.05);CNV3位点与胸宽、胸深和胸围性状均显著相关(P<0.05)。在贵州黑马羊群体中,CNVI、CNV2和CNV3位点与山羊生长性状均无显著相关性。PPP3CA基因的CNV位点间不存在连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)单倍型区块,但可能存在SPT23、SIP4和YOX1转录因子的结合位点。综上所述,在陕北白绒山羊群体中,PPP3CA基因的CNV1、CNV2和CNV3位点可以作为分子标记用于山羊的生长性状选育。

来源：2024年第5期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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