农业生物技术学报

作者：何旭, 朱蒙芳, 董彩奕, 王炫, 杨梦雨, 巩校东, 魏淑珍, 谷守芹, 刘玉卫, 贾慧

单位：1 河北农业大学 生命科学学院/河北省农业微生物生物信息利用技术创新中心/华北作物改良与调控国家重点实验室,保定 071000; 2 河北省湿地保护与绿色发展协同创新中心,衡水 053000

关键词：植物病原真菌,N6-甲基腺嘌呤(m6A)识别蛋白,生物信息学分析,表达模式,

基金：中央引导地方科技发展资金项目(216Z2902G; 236Z6507G); 河北省高校基础科研经费(KY2022037; KY2021042); 河北省自然科学基金(C2020204183)

N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)修饰是真核生物中最常见的RNA修饰。包含YT521-B同源(YT521-B homology, YTH)结构域的蛋白可识别m6A修饰,从而介导RNA代谢。该类蛋白在植物病原真菌中的研究还未见报道。本研究利用生物信息学方法,对127种植物病原真菌中的m6A识别蛋白进行了系统鉴定和分析,并对该类蛋白在玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)发育过程中的基因表达模式进行分析。结果发现,在供试的127个菌株中共鉴定了225个m6A识别蛋白,其中担子菌门中93%真菌含有2个m6A识别蛋白;理化性质分析发现,在鉴定的225个m6A识别蛋白中,有67.56%的蛋白呈碱性,且不同门及不同生活方式真菌的m6A识别蛋白酸碱性存在显著差异。系统发育分析发现,225个m6A识别蛋白可分为5组,其中2组与人类(Homo sapiens)具有较近的进化关系,相同门和相同生活方式真菌的m6A识别蛋白倾向于聚类在同一进化分支上;保守位点分析发现,YTH结构域序列在所有鉴定的m6A识别蛋白中存在多个保守型位点。在玉米大斑病菌中鉴定了1个编码该类蛋白的基因StYTH1,表达量分析发现,其在病菌附着胞发育时期的表达量最高,可能对病菌附着胞发育具有重要的调控作用。本研究为深入揭示m6A识别蛋白的功能提供了基础资料。

来源：2024年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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