农业生物技术学报

作者：梁卫, 王海, 丰勇青, 张澳宁, 田雪纯, 南昕彤, 李文芳, 刘飞云, 马宗桓

单位：1 甘肃农业大学 园艺学院,兰州 730070; 2 兰州金益昇农业科技有限责任公司,兰州 730060

关键词：MYB基因家族,花青素,qRT-PCR,生物信息学分析,

基金：甘肃农业大学学生科研训练计划(SRTP)(202110733019); 高等学校创新基金(2021B-142); 2022年青年导师基金(GAU-QDFC-2022-15); 甘肃农业大学伏羲青年英才(GAUfx-04Y05); 甘肃省青年人才托举工程(GXH202220530-06)

果实着色主要由花青素等黄酮类化合物决定,MYB类转录因子在花青素调控中起着重要的作用。为探究草莓(Fragaria vesca) MYB基因家族对草莓果实着色的作用,本研究通过对拟南芥(Arabidopsis thaliana)和草莓基因数据库的MYB基因家族序列进行同源比对,鉴定出草莓MYB基因家族成员114个。通过生物信息学分析软件对草莓MYB基因家族进行染色体定位、理化性质、亚细胞定位和二级结构分析,确定基因的命名和主要表达的位置;通过共线性、基因结构、启动子顺式作用元件预测等对基因家族进行划分并预测其功能。结果表明,MYB家族成员主要在细胞核中表达;除了FvMYB7外其余都为亲水蛋白;114个成员中有107个蛋白之间存在相互作用;有1个高频密码子的相对同义密码子使用度大于2.0,表明草莓MYB基因中存在极强偏好性的密码子;根据系统进化树可将114个成员分为3个亚族;除FvMYB72不含有任何作用元件,其他成员均含有光、非生物胁迫、激素、分生组织响应元件。qRT-PCR分析表明,大多数成员均在S3时期(50%着色期)相对表达量高,但FvMYB33、FvMYB57、FvMYB75在S4时期(完全着色期)表达量较高;组织特异性表达谱结果表明,只有FvMYB33在果皮中特异性表达,且其花青素含量在S4时期最高;推测FvMYB33为调控草莓果实着色的主要基因。本研究为MYB基因家族在草莓果实着色中的作用机制提供了参考。

来源：2024年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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