国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:胡子昂, 罗平, 辛静静, 崔永一
单位:浙江农林大学 园艺科学学院,杭州 311300
关键词:蝴蝶兰,脱水响应元件结合蛋白(DREB)转录因子,生物信息学分析,亚细胞定位,非生物胁迫,
基金:浙江省农业新品种重大专项花卉育种专项(2021C02071-5); 浙江省“尖兵”“领雁”研发攻关计划项目(2023C02028)
脱水响应元件结合蛋白(dehydration responsive element binding, DREB)基因家族在植物响应低温、干旱和高盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,目前对蝴蝶兰(Phalaenopsis spp.) DREB基因家族的相关研究报道较少。本研究基于阿婆蝴蝶兰(Phalaenopsis aphrodite)基因组数据库,开展了蝴蝶兰DREB家族成员的全基因组鉴定、进化关系分析、生物信息学分析、亚细胞定位和在低温、干旱、高盐3种非生物胁迫及脱落酸(abscisic acid, ABA)处理下的基因表达模式分析。结果显示,在阿婆蝴蝶兰基因组数据库中共鉴定得到了31个DREB家族成员,分为A1~A6共6个亚组;保守基序分析表明,所有PaDREB转录因子均含有1个AP2保守结构域。阿婆蝴蝶兰转录组表达模式分析结果显示,不同PaDREBs呈现组织差异性表达,且多数基因在根部高表达。分离A1亚组4个成员,将其分别命名为:PaDREB1A、PaDREB1B、PaDREB1C和PaDREB1D,亚细胞定位结果表明,其均定位于细胞核。PaDREB1A~PaDREB1D的表达模式分析结果表明,PaDREB1A主要响应干旱、高盐和ABA处理;PaDREB1B主要响应低温和高盐处理;PaDREB1C主要响应干旱和ABA处理;PaDREB1D主要响应低温、干旱和ABA处理。上述结果提示,蝴蝶兰DREB家族在响应非生物胁迫通路中具有重要作用,本研究为后续研究蝴蝶兰DREB家族响应非生物胁迫的作用机理提供理论依据。
来源:2024年第8期
《农业生物技术学报》期刊编辑部