农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第9期:红螯螯虾不同养殖群体和选育群体遗传多样性及遗传结构分析

发布日期:

作者:欧阳苗峰, 陈红林, 刘峰, 周焕, 楼宝, 钱豪杰, 钱伦

单位:1 湖州师范学院 生命科学学院,湖州 313002; 2 浙江省农业科学院 水生生物研究所,杭州 310021; 3 上海海洋大学 水产与生命学院,上海 201306; 4 海宁市鸿海养殖有限公司,海宁 314400; 5 海宁市水产技术服务站,海宁 314400

关键词:红螯螯虾,养殖群体,选育群体,遗传多样性,遗传结构,

基金:浙江省农业(水产)新品种选育重大科技专项(2021C02069-4)

红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)是一种世界性养殖的淡水经济虾类,目前在我国许多地区均有养殖。为了解我国红螯螯虾不同地区及人工选育群体遗传多样性和遗传结构,本研究分别利用15对和20对微卫星标记对10个不同地区红螯螯虾养殖群体和3个世代选育群体进行遗传多样性分析,结果显示,10个养殖群体的平均等位基因数(number of alleles, Na)为5.867~6.867,平均有效等位基因数(effective number of alleles, Ne)为3.090~3.857,香农指数(shannon's diversity index, H')均大于1,平均观测杂合度(observed heterozygosity, Ho)和平均期望杂合度(expected heterozygosity, He)均大于0.5,平均多态信息含量(polymorphism information content, PIC)为0.531~0.595。此外,10个不同地区红螯螯虾养殖群体的基因流(number of migrants per generation, Nm)为11.343~32.526,遗传分化指数(genetic differentiation coefficient, Fst)为0.008~0.027,遗传距离(genetic distance, D)为0.024~0.090,遗传相似系数(genetic similarity index, I)为0.914~0.977。基于D构建的聚类图显示,潮汕与南通、珠海、台湾和平湖群体聚为一个分支,无锡与淮安、海南、诸暨群体聚为一个分支,而汕尾群体单独聚为一个分支。分析3个世代的选育群体发现,其遗传多样性参数发生明显下降,其中,Ho从0.663下降到0.638,H'从1.449下降到1.372,Na从3.509下降到3.303,PIC从0.640下降到0.635,说明通过人工选育导致群体上述各项指标均有所降低。同时,随着选育世代数增加,I从0.961逐渐降低到0.931、D从0.044逐渐升高至0.07,而相邻世代间的I从0.957升高至0.960、Nm从26.262升高至29.895,Fst在渐次变小,其中,选育1代与选育2代间Fst值为0.009,而选育2代与选育3代群体间Fst值降为0.008,进一步说明累代人工选育导致世代间遗传相似性降低,遗传距离增加,世代间的遗传分化逐渐增大。以上研究结果表明,我国不同地区红螯螯虾群体无明显遗传分化,各地区红螯螯虾遗传多样性水平都较高,都可作为良种选育的基础群体;红螯螯虾选育群体经过3代选育后,遗传多样性水平有所降低,但仍处于较高水平,遗传变异与遗传分化水平较低,仍旧具有较强的选育潜力。本研究为红螯螯虾良种选育提供重要的理论依据。

来源:2024年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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