农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第9期:猪TBX3启动子克隆和功能分析

发布日期:

作者:程映皓, 吴筱洁, 沈巧艳, 华进联

单位:西北农林科技大学 动物医学院/陕西省干细胞工程技术研究中心,杨凌 712100

关键词:T-Box转录因子3 (TBX3),启动子,转录因子预测,双荧光素酶实验,KEGG/GO富集分析,

基金:国家重点研发计划(2022YFD1302201); 国家自然科学基金(32072806; 32372970); 陕西省畜牧科技示范项目(20221086)

猪(Sus scrofa)是重要的家畜,诱导干细胞的研究可以促进其育种行业的发展,T-Box转录因子3 (T-box transcription factor 3, TBX3)对猪多能干细胞的干性具有重要的促进和维持作用。为了研究猪TBX3启动子的功能和调控机制,本研究通过序列比对和进化树构建对启动子区域保守性进行评估,并对启动子区域潜在的转录因子结合位点进行预测,对预测的转录因子进行GO和KEGG富集分析解释其参与的生物学过程,最终通过分子克隆和双荧光素酶报告系统验证启动子活性。结果显示,猪TBX3启动子预测区域在哺乳动物中共性程度较低,共性区域参与细胞增殖、分化、凋亡等过程;预测区域含有多种潜在的转录因子结合位点,其参与的信号通路包括干性维持和甲状腺激素信号通路;预测区域具有转录活性,其核心转录启动子处于-246/+64 bp的区域内。本研究通过探讨猪细胞中TBX3转录因子的上游调控机制,为深入理解猪TBX3的转录调控提供参考。

来源:2024年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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