国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:陆洋, 张志强, 卢世雄, 毛娟, 陈佰鸿
单位:甘肃农业大学 园艺学院,兰州 730070
关键词:草莓,Trihelix转录因子家族,生物信息学,表达分析,
基金:甘肃农业大学“伏羲杰出人才培育计划”(Gaufx-03J02)
Trihelix是能与光应答元件GT元件进行特异性结合的转录因子,参与植物的生长发育及逆境胁迫响应。本研究从草莓(Fragaria vesca)全基因组范围内识别Trihelix转录因子家族成员,并对其进行了生物信息学和逆境胁迫下的表达分析。结果显示,草莓Trihelix转录因子家族包含26个成员,分布于chr01~chr07染色体上,其中,chr06染色体上分布最多,有7个Trihelix转录因子家族成员;亚细胞定位预测结果显示,FvTrihelix转录因子家族成员主要定位在细胞核和细胞质;系统进化分析表明,Trihelix蛋白分为5个亚家族,其中Group2、Group3、Group4和Group5分别包含1、3、11和11个FvTrihelix成员。顺式作用元件分析表明,该家族转录因子可能参与激素、干旱和低温胁迫;qRT-PCR结果表明,4 ℃处理下,FvTrihelix14相对表达量均显著高于对照(P<0.05),是对照的8倍,FvTrihelix15的表达量在10% PEG和4 ℃处理下与对照相比差异显著(P<0.05),分别是对照的12和14倍。综上所述,草莓Trihelix转录因子家族成员能够响应不同的逆境胁迫。本研究为草莓抗逆基因的筛选和应用提供了理论依据。
来源:2024年第9期
《农业生物技术学报》期刊编辑部