农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第9期:茄子组蛋白基因家族全基因组鉴定及其低温胁迫下的表达分析

发布日期:

作者:林珲, 黄建都, 陈继兵, 王益奎, 朱海生, 温庆放

单位:1 福建省农业科学院作物研究所 福建省蔬菜遗传育种重点实验室/福建省蔬菜工程技术研究中心,福州 350013; 2 福州市蔬菜科学研究所,福州 350111; 3 广西农业科学院 蔬菜研究所,南宁 530007

关键词:茄子,组蛋白,低温胁迫,表达模式,

基金:福建省属公益类科研院所基本科研专项(2021R1031003); 国家大宗蔬菜产业技术体系福州综合试验站项目(CARS-23-G-53); 福建省种业创新与产业化工程项目(zycxny2021009); 福建省农科院蔬菜遗传育种科技创新团队项目(CXTD2021038)

组蛋白(Histone)是染色质的重要组成部分,在植物生长发育、响应逆境胁迫等方面发挥重要作用。为了探究Histone在低温响应中的特性,本研究通过生物信息学方法对茄子(Solanum melongena)Histone基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,并挖掘其转录组数据,分析了2个不同抗性茄子(品系epl008与eplck)叶片在低温胁迫下Histones的表达模式。结果表明,茄子基因组中共鉴定出40个SmHistones基因,分布在9条染色体上,SmHistone基因家族成员被分成5个亚组(H1, H2A, H2B, H3和H4),同一组中的成员具有相似的理化特性、基因/蛋白质结构和保守基序。种内共线性分析发现,6对SmHistones基因存在共线性关系。启动子分析发现,SmHistone家族基因启动子含有大量低温响应元件、干旱响应元件等非生物胁迫响应元件。转录组和qRT-PCR分析发现,低温胁迫下26个Smhistones基因呈现差异表达,耐低温茄子品系epl008显著上调表达。茄子epl008中SmHistone3对低温胁迫响应诱导表达显著,揭示其可能与抗寒代谢响应密切相关。本研究为培育耐低温的茄子品种奠定了理论基础。

来源:2024年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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