国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:鲁婧童, 孔祥凤, 李介文, 贾桂霞
单位:北京林业大学 园林学院/城乡生态环境北京实验室/林木花卉遗传育种教育部重点实验室/花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心,北京 100083
关键词:百合,病毒检测,多重RT-PCR,序列分析,
基金:国家重点研发计划(2023YFD1200105); 河北省重点研发计划(21326317D)
百合属植物(Lilium spp.)易受多种病毒复合侵染,病毒检测与序列分析有助于明确感染病毒种类、揭示病毒变异情况。本研究基于百合无症病毒(Lily symptomless virus, LSV)、百合斑驳病毒(Lily mottle virus, LMoV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)和车前草花叶病毒(Plantago asiatica mosaic virus, PLAMV)中保守基因序列的4对引物,通过优化PCR延伸时间建立上述4种病毒的多重RT-PCR检测方法,并利用该方法抽检了北京地区田间种植百合的病毒感染情况,进一步分离4种病毒产物进行测序与比对,构建系统进化树。结果表明,在多重RT-PCR反应中,增加延伸反应时间至90 s时可扩增出全部4种病毒及18S rRNA (内参基因)条带;抽样检测结果显示,田间种植的百合多受2种及以上病毒复合侵染,其中病毒检出率由大到小依次为LSV (100%)>CMV (92.31%)>LMoV (30.77%)>PLAMV (15.38%);序列分析发现,4种病毒分离物与其各自同种病毒序列平均相似性在84.4%以上,证明检测所得4种病毒为目标病毒;4种病毒变异分析发现,CMV分离物以百合为寄主时单独聚为一个分支,具有寄主差异性;LMoV在系统发育关系上可分为2个分支,实验中的分离物属于分支Ⅱ;LSV和PLAMV未见明显分支模式。本研究为百合病毒病的常规分子诊断与研究提供技术支持,为病害防治提供基础参考。
来源:2024年第10期
《农业生物技术学报》期刊编辑部