农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第10期:白羽王鸽CAPN11基因SNPs鉴定及其对屠宰性状的影响

发布日期:

作者:向进, 龙霞, 庞金兰, 成敏, 张依裕, 杨阿明

单位:1 贵州大学 动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳 550025; 2 黔西市农业农村局,黔西 551500; 3 贵州裕黔农业生物科技发展有限公司,黔西 551500

关键词:白羽王鸽,钙蛋白酶11基因(CAPN11),SNPs,屠宰性状,

基金:贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑N[2020]2166 号)

白羽王鸽(Columba livia)是重要的经济禽类,探究其钙蛋白酶11 (calpain 11, CAPN11)基因多态性与屠宰性状的关系,对其屠宰性状的遗传改良和经济性状提升具有重要意义。本研究采用PCR直接测序法对白羽王鸽CAPN11基因SNP进行筛查,并分析SNP位点与白羽王鸽屠宰性状的关联性。通过鉴定白羽王鸽的CAPN11基因的SNPs发现,在外显子6区的第636和738位发现g.3641644 C>T和g.3641746 C>T 2个同义突变,均存在3种基因型,优势基因型和优势等位基因均为CT和C,0.25<PIC<0.5均呈中度多态;χ2检验显示,2个SNPs位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);连锁不平衡分析显示,2个SNPs位点之间不满足D'>0.80,r2>0.33,表明不存在强连锁不平衡效应;关联性分析显示,g.3641644 C>T位点对宰前活重的影响达到显著水平(P<0.05);g.3641746 C>T位点对白羽王鸽的宰前活重、屠体重、全净膛重、胸肌重和腿肌重等屠宰性状的影响均达到了显著水平(P<0.05);双倍型分析发现,2个SNPs位点在实验群体中共检测到4种单倍型和10种双倍型,双倍型H2H2 (CCTT)个体的宰前活重、屠体重、全净膛重和腿肌重均显著高于其他9种双倍型(P<0.05);双倍型H2H2 (CCTT)个体的胸肌重显著高于除双倍型H3H3 (TTCC)和H3H4 (TTCT)外的其他双倍型个体(P<0.05)。通过分析单倍型mRNA二级结构发现,单倍型H1 (CC)、H2 (CT)、H3 (TC)均引起了CAPN11基因的mRNA二级结构变化,可能会影响转录和翻译效率,进而影响屠宰性能。综上,CAPN11基因能够作为潜在候选基因用于改善白羽王鸽屠宰性状,为加速白羽王鸽育种选育进程提供一定的理论依据,为提升品种屠宰性状的分子标记选育工作提供参考。

来源:2024年第10期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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