农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第10期:红麻基因组WRKY家族成员的鉴定及其在镉胁迫下的表达分析

发布日期:

作者:李辉, 陈安国, 唐慧娟, 栾明宝

单位:1 湖南文理学院 生命与环境科学学院,常德 415000; 2 中国农业科学院 麻类研究所,长沙 410205; 3 三亚中国农业科学院国家南繁研究院,三亚 572000

关键词:红麻,镉胁迫,WRKY基因家族,

基金:湖南省教育厅重点项目(21A0422); 湖南省自然科学基金(2024JJ5290); 国家麻类产业技术体系(CARS-16-E5); 中国农业科学院科技创新工程(一年生麻类遗传改良)(ASTIP-IBFC03)

重金属镉污染农田的修复是世界性的难题。红麻(Hibiscus cannabinus)耐逆性强,可用于镉污染农田的修复。为了探索红麻WRKY家族成员对镉胁迫的响应模式,本研究利用HMMER和BLAST软件在红麻基因组中鉴定获得HcWRKY家族成员,并通过ExPasy在线网站获得了HcWRKY家族成员的分子信息,同时利用TBtools v1.6软件将家族成员全部定位到相应染色体上。结果表明,33个HcWRKY家族成员不均匀地分布在12条染色体上,其理化性质,如氨基酸数量、蛋白质分子量和理论等电点各不相同。除HcWRKY4-2位于细胞质外,其他HcWRKY成员均定位于细胞核内。系统发育分析表明,33个HcWRKY蛋白分为4组:其中第Ⅱ组和第Ⅳ组仅含HcWRKY家族成员;第Ⅰ组和Ⅲ组同时含有HcWRKY和AtWRKY家族成员。实时荧光定量PCR分析表明,受镉胁迫诱导表达的HcWRKY家族成员有24个。在红麻响应镉胁迫反应过程中22个HcWRKY家族成员基因表达量上调,2个HcWRKY家族成员基因表达量下调。这可能是红麻耐镉能力强的一个重要因素。本研究结果为进一步探索HcWRKY基因家族在红麻响应镉胁迫过程中的生物学功能提供了基础资料。

来源:2024年第10期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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