农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2024年第11期:水稻粒型全基因组关联分析

发布日期:

作者:龚成云, 朱裕敬, 桂金鑫, 石居斌, 罗新阳, 曾哲, 张海清, 贺记外

单位:湖南农业大学 农学院,长沙 410128

关键词:粒型,QTL,全基因组关联分析(GWAS),单倍型,聚合,

基金:湖南省自然科学基金(2020JJ5232)

水稻(Oryza sativa)粒型是决定水稻产量、稻米外观、营养品质和商品价值的重要因素,粒型主要受遗传因素的调控。挖掘并利用水稻粒型优异基因资源并解析其调控水稻粒型的分子机制,是进一步改良稻米品质和提高水稻产量的重要策略。本研究以410份3K水稻核心种质为研究材料,于种子成熟后测量粒长、粒宽和粒厚,结合种质基因型进行水稻粒型全基因组关联分析(genome-wide association analysis, GWAS),并对定位到的粒型QTL进行候选基因以及候选基因单倍型分析,筛选这些QTL的候选基因。结果表明,GWAS共检测到5个粒型相关的QTL,分布在水稻1、3、5、7和8号染色体上,控制粒长的QTL有qGL3、qGL7和qGL8,其中qGL3与GS3共定位,qGL7与GL7共定位,而qGL8为控制粒长的新QTL位点;控制粒宽的QTL有qGW5,与GW5共定位;控制粒厚的QTL为qGT1,与d61共定位。初步筛选到qGL8的候选基因为Os08g0421800。分析粒长QTL不同单倍型在种质中的聚合情况,结果显示,qGL3、qGL7和qGL8候选基因优异单倍型聚合在'B073'、'B081'等8份种质中,这8份种质谷粒均为细长型。本研究为水稻粒型的遗传改良提供了新的种质资源和理论支撑。

来源:2024年第11期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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