农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2023年第2期:小麦Whirly基因家族的鉴定及表达分析

发布日期:

作者:孙月, 杨慧玉, 朱文根, 王小燕, 唐益苗

单位:1 长江大学 农学院,荆州 434000; 2 北京市农林科学院 杂交小麦研究所,北京 100000

关键词:小麦,Whirly基因家族,生物信息学分析,非生物胁迫,表达分析,

基金:北京市农林科学院协同创新中心资助项目(KJCX201907-2); 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20200423)

Whirly家族属于植物特有的转录因子,在多种植物生长发育、抗病和胁迫响应等方面发挥着重要作用。为探究小麦(Triticum aestivum) Whirly家族成员数量及潜在功能,本研究借助生物信息学方法,对鉴定到的6个TaWHYs成员(分别命名为TaWHY1-A, TaWHY1-A-1, TaWHY1-D, TaWHY2-A, TaWHY2-B, TaWHY2-D)进行蛋白理化性质、基因结构、蛋白三维结构及系统进化分析;使用qPCR对TaWHYs成员在干旱、高温、低温胁迫下的表达模式进行分析。结果表明,TaWHYs蛋白不稳定指数为30~60,亲水性平均系数小于0,蛋白性质稳定,属于亲水蛋白。亚细胞定位预测显示,TaWHYs蛋白在细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体中均有分布。TaWHYs蛋白二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,存在2种三维结构模型。转录组数据分析表明,TaWHY基因表现出不同的组织表达模式,并受到低温、高温、干旱等不同非生物胁迫的调控。qPCR结果表明,TaWHY1-A基因在低温胁迫条件下相对表达量显著上调(P<0.05),能够响应低温胁迫。本研究结果为更深层次的TaWHY功能验证和作用机理分析提供参考。

来源:2023年第2期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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