农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2023年第3期:马尾松SPL基因家族鉴定及其响应低磷胁迫的表达分析

发布日期:

作者:王春昱, 范付华

单位:1 贵州大学 贵州省森林资源与环境研究中心/贵州省高原山地林木培育重点实验室,贵阳 550025; 2 贵州大学 林学院,贵阳 550025

关键词:SPL基因家族,马尾松,生物信息学,低磷胁迫,

基金:贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2018]5261)

SPL (SQUAMOSA promoter binding protein (SBP)-like)是植物特有的转录因子,在植物生长发育和代谢中具有重要作用。本研究基于课题组前期获得的马尾松(Pinus massoniana)转录组数据筛选SPL家族成员,通过生物信息学方法,对马尾松SPL基因家族成员进行蛋白理化性质分析、亚细胞定位预测、保守蛋白基序(motif)分析和系统进化树分析。结果显示,在马尾松转录组数据中筛选出11个家族成员,预测所有家族成员定位于细胞核,编码蛋白质由190~1 147个氨基酸组成,相对分子质量为21.6~127.1 kD;所有序列都含有motif1~3,为SBP结构域保守基序;11个PmSPL成员都含有2个C2HC锌指结构和1个核定位信号。利用qRT-PCR技术检测PmSPL基因家族对低磷胁迫的响应,结果显示,在低磷处理不同时间的马尾松幼苗地上和地下部分,PmSPL3和PmSPL8表达均没有显著变化,对低磷胁迫没有响应;PmSPL4和PmSPL6在低磷处理12 d的地上和地下部分均显著上调表达,可能在低磷胁迫响应中发挥作用。本研究结果为进一步揭示马尾松SPL基因响应低磷胁迫的生物学功能提供参考依据。

来源:2023年第3期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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