农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2023年第3期:小麦PDR基因家族的鉴定与表达分析

发布日期:

作者:何浩, 王志明, 张立强, 唐艺真, 夏琪, 李忠源, 张怀渝

单位:四川农业大学 生命科学学院,雅安 625014

关键词:小麦,PDR基因家族,生物信息学分析,非生物胁迫,

基金:国家自然科学基金(31971940)

多向耐药性蛋白(pleiotropic drug resistance, PDR)是ABC转运蛋白超家族重要的亚家族成员,在响应外界胁迫和植物生长发育的生理过程中发挥着重要作用,但在小麦(Triticum aestivum)中研究较少。为探讨小麦PDR基因家族对逆境胁迫的响应,本研究对小麦PDR基因家族进行了全基因组鉴定和生物信息学分析,并通过qPCR方法验证其在非生物胁迫下的响应情况。结果显示,小麦中共鉴定出76个TaPDRs基因,主要位于3、5和7号染色体上,编码氨基酸1 242~1 517个,分子量为140.69~170.99 kD,预测等电点范围为6.22~8.94;系统进化分析将TaPDRs基因分为5类(ClassⅠ~Ⅴ),多数TaPDRs蛋白基序具有高度的保守性,同一类型TaPDRs具有较为相似的基因结构;基因复制分析共发现10组串联复制基因和56对片段复制基因;组织特异性分析发现,TaPDRs基因在小麦不同组织中的表达水平有较大差异,大多在根组织中高表达;qPCR结果显示,TaPDRs基因能够不同程度的响应盐、干旱、镉胁迫以及脱落酸处理。本研究为探索TaPDRs基因在非生物胁迫响应中的作用提供参考。

来源:2023年第3期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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