农业生物技术学报

作者：王长峰, 韩玲, 李爱霞, 余群力, 张丽, 石红梅, 孔祥颖, 朱潇鹏, 张新军

单位：1 甘肃农业大学 食品科学与工程学院,兰州 730070;2 甘肃省甘南州畜牧兽医工作站,甘南 747000;3 青海省海北畜牧兽医科学研究所,海 北 812200;4 甘肃万禾草畜产业科技开发有限公司,兰州 730070;5 宁夏夏华肉食品有限公司,中卫 755000

关键词：娟犏牛,RNA-seq,差异表达基因,保水性,肌肉,

基金：国家现代农业产业技术体系(CARS-37); 甘肃省高等学校产业支撑引导项目(2020C-18); 甘肃省科技计划资助项

肌肉保水性是食用肉类品质重要特征之一,其极大地影响肉的感官特性和经济价值。为了筛选影响甘南娟犏牛(Bos taurus)肌肉保水性相关的差异表达基因,本研究选取健康、生长发育良好、出栏时间相同、体重均匀的牦牛(Bos grunniens)和娟犏牛各3头,采集背最长肌为受试材料,进行蒸煮损失、加压损失、滴水损失测定和 RNA-seq 转录组测序,以差异表达倍数值|log2 (Fold change)|≥1 且显著性水平 P<0.05 作为挑选差异表达基因的条件。结果显示,牦牛蒸煮损失和滴水损失显著高于娟犏牛(P<0.05),加压损失显著低于娟犏牛(P<0.05);测序结果共得到748个差异表达基因 ,其中526个下调、222 个上调。为了验证测序数据的可靠性,随机选取6个差异表达基因进行 qRT-PCR 验证,基因表达趋势与转录组测序结果一致 ,表明测序结果可靠。通过 GO 功能注释和 KEGG 通路富集分析发现 ,与肌肉保水性相关的条目有纤维蛋白的溶解、蛋白质的分解、葡萄糖代谢过程及肌动蛋白细胞骨架组织的调节,参与保水性相关的通路有糖酵解/糖异生 、过氧化物酶体增殖激活受体(peroxisome proliferator activated receptor, PPAR)及 AMP 依赖的蛋白激酶(AMP-activated protein kinase, AMPK)信号通路等 ;共获得55个非冗余的差异表达基 因 ,其中 肌钙 蛋白 T2 (troponin T type 2, TNNT2)、骨形 态发 生蛋 白 1 (bone morphogenetic protein 1, BMP1)、脂肪酸结合蛋白 1 (fatty acid-binding protein 1, FABP1)和低密脂蛋白受体相关蛋白 1 (low-density lipoprotein receptor-related protein-1, LRP1)与娟犏牛保水性相关,可作为娟犏牛肉质性状遗传育种改良的候选基因。本研究为深入开展牛肌肉保水性的分子机制研究提供基础资料。

来源：2023年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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