农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2023年第8期:黑果枸杞花青素介导低氧诱导的H9c2 大鼠心肌细胞 ceRNA 调控网络构建

发布日期:

作者:李金铭, 吴华, 舒美玲, 沈童, 武小庆, 王硕, 李汶蒲

单位:青海大学 农牧学院,西宁 810016

关键词:黑果枸杞花青素,H9c2 大鼠心肌细胞,环状 RNA (circRNA),竞争性内源 RNA (ceRNA)网络,低氧,保护效应,

基金:青海省科学技术厅自然科学基金(2022-ZJ-927)

环状 RNAs (circular RNAs, circRNAs)作为高效竞争性内源 RNA (competing endogenous RNA, ceRNA),通过miRNA 海绵效应调节细胞分化、增殖、凋亡和能量代谢等参与调控低氧诱导的细胞生物过程。 黑果枸杞(Lycium ruthenicum)富含花青素(anthocyanins)。花青素具有较强的抗氧化能力,可以有效缓解心肌细胞缺氧损伤。本研究利用RNA-seq 技术和生物信息学方法筛选差异表达的circRNA、miRNA 和mRNA, 构建 circRNA-miRNA-mRNA 调控网络,利用qRT-PCR 筛选可能参与黑果枸杞花青素对低氧诱导的H9c2 大鼠(Rattus norvegicus)心肌细胞调控的ceRNA 关系对。结果显示,差异表达的1 570 个 mRNAs、5 个 miRNAs 和4 个 circRNAs 是低氧相关分子,可能参与黑果枸杞花青素对低氧诱导的H9c2 大鼠心肌细胞的调控。 基于皮尔逊相关性分析和靶关系预测,成功构建 ceRNA 网络,并利用qRT-PCR 筛选到 2 个候选的circRNA-miRNA-mRNA 关系对。本研究为深入探讨 circRNA 及其靶基因参与调控黑果枸杞花青素对心肌细胞保护作用的机制提供基础资料。

来源:2023年第8期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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