国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:焦小雨, 吴琼, 刘丹丹, 孙明慧, 王文杰
单位:安徽省农业科学院 茶叶研究所,合肥 230001
关键词:茶树,细胞壁关联蛋白激酶(WAK)基因家族,胁迫应答,生物信息学,
基金:安徽省重大专项(202003a06020021); 安徽省茶叶产业技术体系(AHCYJSTX-11); 安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室开放基金(SKLTOF20220120); 安徽省农业科学院成果推广项目(2023YL031)
细胞壁关联蛋白激酶(wall-associated kinase, WAK)是一类特殊的类受体蛋白激酶(receptor like kinase, RLK),在调节细胞生长和防御胁迫反应等方面发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法从茶树(Camellia sinensis)全基因组中鉴定出27个CsWAK成员,主要以基因簇的形式分布于2个染色体和1个组装片段上。根据系统进化关系将CsWAK分为5个亚组(Ⅰ~Ⅴ),同一亚组中的多数成员具有相似的基因结构和保守基序。转录组数据分析结果显示,大多数CsWAK成员在茶树的叶中高表达,其次是在根和茎中。在激素、低温、高盐等逆境胁迫下,CsWAK中多数成员基因表达变化差异不明显,少数基因表达变化显著,具有多样化和特异性。此外,对部分响应冷胁迫、PEG胁迫和盐胁迫的差异表达基因进行了qPCR分析。结果显示,低温处理下,所选9个基因均呈现先上升后下降的表达模式,且多数基因在低温处理3 h表达水平上调最为明显;在PEG处理下,所选9个基因的表达水平与转录组数据略有不同,但表达趋势相似;在NaCl处理下,所选9个基因的表达水平较未处理时显著下调,其中,CsWAK14对盐胁迫最为敏感。本研究结果为进一步解析CsWAK基因的生物学功能提供参考。
来源:2023年第9期
《农业生物技术学报》期刊编辑部