国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:赵望龙, 李嘉琪, 李猛, 王吉庆, 肖怀娟, 杜清洁, 李娟起
单位:河南农业大学 园艺学院,郑州 450046
关键词:甜瓜,组氨酸磷酸转运蛋白AHP家族,基因鉴定,低温,表达分析,
基金:国家自然科学基金(32202578); 中国博士后科学基金(2022M711063); 河南农业大学大学生创新训练项目
组氨酸磷酸转运蛋白AHPs (Arabidopsis histidine phosphotransfer proteins)在植物生长发育和抵御生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。为探讨甜瓜(Cucumis melo) AHP的生物学功能和表达模式,本研究采用生物信息学分析、转录组测序和qRT-PCR等技术,对甜瓜AHP基因家族成员的数量、染色体位置、基因结构、亚细胞定位、蛋白保守基序、系统进化、启动子及基因表达等进行分析。结果表明,甜瓜AHP家族共有7个成员,分布于7条染色体上;氨基酸长度为109~412 aa,均表现为亲水性,全部成员均定位在细胞核或细胞外基质。系统进化分析发现,甜瓜AHP基因家族成员与黄瓜(Cucumis sativus)亲缘关系最近。预测分析发现,启动子上主要包含光响应、激素响应等顺式作用元件。转录组数据预测CmAHP5和CmAHP7在甜瓜的根、叶、雌花、雄花和果实中均有较高的表达,且二者在果实发育和成熟过程中可能起负调控作用;针对枯萎病和白粉病,CmAHP5可能起负调控作用,而CmAHP7可能起正调控作用。qRT-PCR证实CmAHP1~CmAHP5均参与低温响应,其中CmAHP4可能是关键的候选基因。本研究结果可为解析甜瓜AHP基因功能提供理论参考。
来源:2023年第9期
《农业生物技术学报》期刊编辑部