农业生物技术学报

作者：王敏, 陈锦秀, 邰翔, 朱晓炜, 任云英, 薄天岳

单位：上海市农业科学院 园艺所/上海市设施园艺重点实验室 上海 201403

关键词：甘蓝,VQ家族,生物信息学分析,根肿病,表达分析,

基金：上海市科技创新行动计划农业领域项目(21N51900400); 上海市农业农村委科技兴农项目(2022-02-08-00-12-F01099); 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-25); 卓越团队项目(农科卓2022(005))

VQ蛋白是一类包含"FxxxVQxLTG"保守基序的氨基酸序列,是植物特有的蛋白家族,参与植物生长发育和各种胁迫响应过程。为了明确甘蓝(Brassica oleracea var. capitata) VQ基因家族的生物学功能,本研究从甘蓝全基因组中共鉴定出67个甘蓝VQ基因(BoVQ),对其进行生物信息学和表达模式分析。系统发育分析表明VQ基因共划分为7个亚组。染色体定位显示BoVQ基因在甘蓝9条染色体上呈不均匀地单一或成簇分布。转录组测序数据表明BoVQ基因在甘蓝的不同组织表达存在差异。11个BoVQ基因(BoVQ10, BoVQ20, BoVQ22, BoVQ32, BoVQ36, BoVQ43, BoVQ49, BoVQ54, BoVQ59, BoVQ60和BoVQ67)参与甘蓝花发育的整个过程。实时荧光定量PCR (qRT-PCR)结果显示,BoVQ2、BoVQ12、BoVQ21、BoVQ26和BoVQ44基因在根肿病菌侵染下显著高表达。启动子顺式元件分析表明,病原菌应答元件W-box和防御与应激反应元件TC-rich repeats在响应根肿病菌(Plasmodiophora brassicae)诱导的VQ基因启动子区域富集。蛋白互作网络预测BoVQ蛋白之间存在复杂的互作关系。该研究为进一步探索BoVQ基因在甘蓝中的功能和进化提供参考。

来源：2023年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

查看农业生物技术学报杂志2023年第9期