农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2023年第11期:马铃薯StbZIP10基因生物信息学及其锌胁迫下的表达分析

发布日期:

作者:刘昊天, 赵婧, 唐勋, 赵贵宾, 朱永永, 张宁, 司怀军

单位:1 甘肃农业大学 生命科学技术学院/省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,兰州 730070; 2 甘肃省农业信息中心,兰州 730030; 3 甘肃省农业技术推广总站,兰州 730020

关键词:锌胁迫,马铃薯,StbZIP10,生物信息学,亚细胞定位,

基金:甘肃省农业农村厅科技项目(GNKJ-2021-25; GNKJ-2021-26); 联合国世界粮食计划署(WFP)项目(WFPGSPP-1)

锌在植物生长和发育的许多方面发挥作用。但过量的锌和缺锌均会导致生理生化紊乱,形成锌胁迫。碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP)转录因子在调控植物生长发育、响应胁迫应答方面具有重要作用。本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)品种'Atlantic'为材料,克隆得到StbZIP10基因(GenBank No. XM_006359636.1),该基因全长1 653 bp,CDS长为819 bp,共编码272个氨基酸。生物信息学分析表明,StbZIP10是相对分子质量为29.68 kD的疏水性跨膜蛋白,具有典型的bZIP保守结构域。亚细胞定位结果显示,StbZIP10蛋白主要在细胞核和细胞膜上表达。利用qRT-PCR对马铃薯StbZIP10基因进行组织特异性表达分析,结果表明,StbZIP10基因在马铃薯根中表达量最高,叶中表达量最低,并且各组织之间表达量存在显著性差异。在缺锌条件下,马铃薯'Atlantic'和'陇薯7号'品种中StbZIP10的表达模式相同,都为根部表达量最高。在缺锌处理下,StbZIP10在两品种中的表达水平均有提升,但在品种'陇薯7号'的表达量显著高于'Atlantic' (P<0.05),且3个时间段内趋势基本相同。本研究为进一步阐明StbZIP10基因功能提供了基础资料。

来源:2023年第11期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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