农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2022年第1期:地被菊bHLH转录因子基因家族鉴定及其低温胁迫响应

发布日期:

作者:任镘蓉, 全英杰, 杨雯婷, 何子涵, 张佳凝, 高日

单位:延边大学 农学院,延吉 133002

关键词:地被菊,碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,基因家族,低温胁迫,

基金:国家自然科学基金(32060696); 延边州科技发展计划项目(2020FG31); 延边大学校企合作项目(延大科合字2020); 延边大学青年基金[延大科合字(2017)第21号]; 延边大学博士科研启动基金(2018); 农业农村部景观设计重点实验室开放课题(KF201902)

地被菊(Chrysanthemum morifolium)是菊科菊属多年生宿根草本植物,花型整齐,色彩多样,有较高的观赏价值。北方地区温度低,严重限制了地被菊的栽培范围。碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix, bHLH)转录因子家族广泛参与植物的生长发育和非生物胁迫响应。本研究以地被菊'映洁'为材料,根据转录组数据克隆了17个CmbHLHs基因,ORF在603~1 242 bp之间,对蛋白理化性质进行预测分析发现,17个CmbHLHs蛋白中8个蛋白为酸性,9个蛋白为碱性,这些蛋白都定位在细胞核上。bHLH蛋白二级结构α-螺旋占比为25.49%~51.50%,β-转角占比为1.42%~5.88%;miRNA预测分析显示,9个miRNA可能调控8个CmbHLHs基因转录后的表达。利用MEME软件预测CmbHLH基序组成,共鉴定出6个保守基序,除CmbHLH8和CmbHLH15外,其他蛋白都包含基序1和基序2。系统发育分析显示,17个CmbHLHs基因分布于12个bHLH亚家族。低温处理地被菊幼苗,qPCR分析发现,7个CmbHLHs基因受到低温胁迫诱导后表达量增加。本研究可为地被菊bHLH基因功能的进一步研究提供参考。

来源:2022年第1期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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