农业生物技术学报

作者：钱禛锋, 谷杰, 赵雪婷, 饶席兵, 曾丹, 沈庆庆, 张蓉琼, 陈疏影, 何丽莲, 李富生

单位：1 云南农业大学 农学与生物技术学院,昆明 650201; 2 云南农业大学 甘蔗研究所,昆明 650201

关键词：蔗茅,类钙调蛋白(CML)家族,生物信息学分析,冷胁迫,表达分析,

基金：国家自然科学基金(31960451; 31560417); 云南省应用基础研究计划重点项目(2015FA024)

类钙调蛋白(calmodulin-like protein, CML)是植物细胞中的钙离子结合蛋白,在植物生长发育和 逆境胁迫的信号转导中具有重要的功能。为探究冷胁迫下蔗茅(Erianthus fulvus) CML 家族基因的表达模 式,本研究基于转录组数据在蔗茅中鉴定出 39 个 EfCML 家族基因,并进行了生物信息学和冷胁迫下的表 达分析。蛋白质理化性质分析表明 ,蔗茅 EfCMLs 氨基酸残基数目为 59~312,分子量大小为 6.240 21~34.017 78 kD,等电点为 3.99~11.14。亚细胞定位预测结果显示,39 个 EfCMLs 分别定位于细胞质、细胞膜 和细胞核中。保守结构域分析发现,EfCML 家族蛋白含有 1~4 个典型的 EF-hand 结构域。基序(motif)分 析表明,EfCML 家族蛋白含有 1~4 个典型的 Ca2+结合基序。进化树分析表明,EfCMLs 蛋白分为 11 个组群。冷胁迫表达分析表明,低温诱导 EfCML 家族基因差异表达,其中 EfCML1 和 EfCML2 基因表达持续上调,在 72 h 冷胁迫下达到峰值,分别为对照的 27 和 35 倍(P<0.01),呈现最活跃状态。本研究为深入解析 蔗茅 CML 基因的冷胁迫调控机理提供基础资料。

来源：2022年第5期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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