农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2022年第7期:青海高原型牦牛 SCD 基因 SNP 及单倍型与生长性状的关联性分析

发布日期:

作者:祁增源, 高占红, 周建强, 韩银仓, 刘秀, 孙永刚

单位:1 甘肃农业大学 动物科学技术学院/甘肃省草食动物生物技术重点实验室,兰州 730070;2 青海省畜牧兽医科学院,西宁 810016

关键词:高原型牦牛,硬脂酰辅酶 A 去饱和酶基因(SCD),DNA 测序,生长性状,

硬脂酰辅酶 A 去饱和酶(stearyl-CoA desaturase, SCD)是牦牛(Bos grunniens)体内单不饱和脂肪酸 (monounsaturated fatty acid, MUFA)生物合成的关键酶,对脂质合成和氧化的动态平衡调节过程有着重要 的作用。为探索青海高原型牦牛 SCD 基因多态性及其与生长性状的关联性,通过 DNA 测序法进行基因 的多态性分析,应用连锁不平衡分析和一般线性模型(general linear model, GLM)进行关联性分析。结果表明 ,SCD 基因第 3 内含子上存在 2 个 SNP (g.6614C>A 和 g.6660C>T),其中 g.6614C>A 上存在 2 种基因 型 ,g.6660C>T 上存在 3 种基因型 ;χ2 检验表明 ,g.6614C>A 处于哈代温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态 , g.6660C>T 处于不平衡状态 ,且 g.6614C>A 为低度多态(PIC<0.25),g.6660C>T 为中度多态(0.50>PIC>0.25)。与生长性状关联性分析发现,g.6614C>A 位点上 CA 基因型的体重、体高、体斜长和管围显著高于 CC 基因型(P<0.05),而胸围与 CC 基因型差异不显著。g.6660C>T 位点上 TT 基因型个体的体长与 CT 和 CC 基因型差异不显著 ,体重、体高和胸围显著高于 CC 和 CT 基因型(P<0.05),管围极显著高于 CC 基因 型(P<0.01)。单倍型和连锁不平衡分析发现 2 个位点存在 4 种单倍型,位点间不存在强连锁性(r2=0.027)。 组合单倍型分析发现,H1H3 为最优组合单倍型。综上,SCD 基因多态性与青海高原型牦牛的部分生长性 状相关,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因,本研究为提高牦牛选种效率提供参考。

来源:2022年第7期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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