国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:苏文娟, 陈霞, 曹瑞兰, 陈尚钘, 刘洲莹, 刘娟
单位:江西农业大学 林学院/江西省森林培育重点实验室,南昌 330045
关键词:山苍子,WRKY 基因家族,生物信息学分析,表达分析,
山苍子(Litsea cubeba)是我国南方地区重要的木本香料树种之一,在生长过程中极易遭受生物和 非生物胁迫影响。WRKY 转录因子在植物生长发育、胁迫应答等过程中发挥着重要作用。本研究基于 生物信息学分析 ,鉴定出 41 个 LcWRKY 家族基因 ,利用转录组数据和 qPCR 验证 ,分析并探讨其在不同 组织中的表达特异性。系统进化发育显示,LcWRKY 家族成员分为 2 个类群,其中第 2 个类群包含 5 个亚类Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d 和Ⅱ-e。对 LcWRKY 基因的保守基序和结构域进行分析,结果证实了系统发育聚类分析的准确性。蛋白互作网络共表达分析表明 ,LcWRKY36、LcWRKY38 和 LcWRKY39 等处于共线中心,推测其在山苍子响应病害、低磷胁迫等调控过程中起着关键作用。不同组织的转录组分析发现,41 个 LcWRKY 成员在不同组织中差异表达,其中 LcWRKY1、LcWRKY3、LcWRKY8 等 10 个基因在根中呈现明 显的高表达,LcWRKY8 在根中的表达量是叶中的 25 倍(P<0.01),推测其在根系发育和逆境胁迫中发挥重 要作用。此外 ,LcWRKY29、LcWRKY10、LcWRKY15、LcWRKY22 和 LcWRKY1 等基因在果实中的相对表达量 较高 ,推测其可能参与山苍子果实柠檬醛等次生代谢产物的生物合成。本研究为进一步解析山苍子 WRKY 转录因子的功能提供基础资料。
来源:2022年第7期
《农业生物技术学报》期刊编辑部