农业生物技术学报

作者：马兰花, 张永峰, 顾亚荣, 陈祎玮, 阎萍, 潘和平

单位：1 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所/甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州 730030;2 西北民族大学 生命科学与工程学院,兰州 730030

关键词：牦牛,m6A阅读蛋白,YTHDF2,时空表达规律,生信分析,

基金：中国农业科学院牦牛资源与育种创新团队(CAASASTIP-2014-LIHPS-01); 甘肃省重点研发计划(17YF1NA067); 国家自然科学基金(31972561)

YT521-B homology domains 2 (YTHDF2)作为RNA结合蛋白,能够识别N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)修饰,在哺乳动物生长发育中起着关键作用。为了解牦牛(Bos grunniens) YTHDF2基因在牦牛脂肪沉积中的作用,本研究克隆牦牛脂肪组织中的YTHDF2 CDS区并进行生物信息学分析,利用qPCR技术探究YTHDF2 mRNA的时空表达规律。结果发现,YTHDF2 mRNA CDS区全长1 743 bp,共编码580个氨基酸;YTHDF2亲缘关系与野牦牛最近;氨基酸等电点是8.87,不稳定系数(Ⅱ)为50.00,蛋白总平均亲水性为-0.66,YTHDF2蛋白总体表现出较强的亲水性,有1个大小为133 bp的YTH保守结构域,无信号肽和跨膜结构域,共有69个潜在磷酸化位点。YTHDF2蛋白高级结构由无规则卷曲(67.59%)、α-螺旋(15.15%)、延伸链(12.24%)和β-转角(4.66%)相互连接而成。YTHDF2与甲基化修饰相关蛋白相互作用,对RNA特异性结合具有重要作用。qPCR结果显示：在空间维度上,YTHDF2基因在牦牛7个组织中均有表达,背最长肌中表达量最高(P<0.05);时间维度上,18和30月龄2个阶段脂肪组织中的YTHDF2表达差异不显著;进一步研究发现在牦牛前体脂肪细胞分化过程中,YTHDF2表达量呈现上升的趋势,4、8和12 d的表达量显著高于0 d (P<0.05))。研究结果显示,牦牛YTHDF2是1个具有YTH保守结构域的碱性不稳定水溶性蛋白,初步表明YTHDF2在牦牛脂肪沉积过程中发挥着重要的作用。本研究为进一步研究牦牛YTHDF2基因对脂肪沉积调控及其功能提供了参考。

来源：2022年第8期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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