国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:贾明轩, 周贺, 王茂存, 孙菡笛, 程圳, 范永山, 巩校东, 谷守芹, 刘玉卫, 董金皋
单位:1 河北农业大学 生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室/华北作物改良与调控国家重点实验室,保定 071000; 2 唐山师范学院 生命科学系,唐山 063002
关键词:植物病原真菌,mRNA甲基化,RNA甲基转移酶,生物信息学分析,
基金:国家自然科学基金(31671983); 河北省自然科学基金(C2019204211; C2019105055); 中央引导地方科技发展资金(216Z2902G); 现代农业产业技术体系专项(CARS-02); 河北农业大学中青年骨干教师境外研修计划项目
RNA甲基化是最主要的RNA修饰方式,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)是真核生物mRNA最常见的一种转录后修饰,在生物生长发育过程中发挥重要的调控作用。作为RNA甲基化修饰的重要蛋白,RNA甲基转移酶在植物病原真菌中的功能尚未见报道。本研究利用生物信息学方法,对植物病原真菌RNA甲基转移酶的结构及功能进行了初步探究。结果表明,在106种植物病原真菌中,共鉴定到159个RNA甲基转移酶基因,通过理化性质分析可知,159个植物病原真菌RNA甲基转移酶编码氨基酸的平均长度约为470 aa (变化范围: 179~1206 aa),平均相对分子量约为52.64 kD (变化范围: 20.04~134.35 kD),平均等电点约为7.26 (变化范围: 4.90~10.28)。植物病原真菌RNA甲基转移酶的进化关系较为保守,相同门的植物病原真菌RNA甲基转移酶大体聚集在同一进化枝,且同一进化枝中蛋白保守基序的相似性较高。利用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)方法对玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)中编码RNA甲基转移酶(S. turcica RNA methyltransferases 1, StMETTL1)的基因在病菌不同发育时期的表达量进行分析发现,StMETTL1在侵染钉时期的表达量显著升高(P<0.05),推测StMETTL1可能在玉米大斑病菌侵染宿主过程中发挥了重要的作用。本研究为进一步了解m6A在植物病原真菌中的作用提供了数据支持。
来源:2022年第9期
《农业生物技术学报》期刊编辑部