农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2022年第9期:基于转录组测序的ITGAD基因InDel位点鉴定及其与山羊生长性状的关联性分析

发布日期:

作者:吴贤锋, 王金宝, 刘远, 池春梅, 黄勤楼, 李文杨

单位:1 福建省农业科学院 畜牧兽医研究所,福州 350000; 2 宁德市农业科学研究所,福安 355017

关键词:山羊,β2整合素αD (ITGAD)基因,插入缺失(InDel),高分辨率熔解曲线(HRM),生长性状,

基金:福建省农业科学院探索类项目(ZYTS2019020); 福建省省属公益类科研院所基本科研专项(2020R10260012; 2020R10260014; 2019R1026-10)

β2整合素αD (β2 integrins αD, ITGAD)是一种异二聚体细胞表面受体的亚基,在调控脂肪新陈代谢和血糖平衡中发挥重要作用。为了加快山羊(Capra hircus)生长性状选育的遗传进展,为山羊生长性状的标记辅助选择(marker assisted selection, MAS)提供理论依据,本研究利用DNA池技术和高分辨率熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术,检测了ITGAD基因在3个山羊品种(共355只)的插入/缺失(Insertion/Deletion, InDel)多态性,并分析其与山羊生长性状之间的关联效应。结果表明,检测到1个山羊ITGAD基因第15个内含子的新InDel位点(NC_030832.1: g.15243_15244 ins C),其多态信息含量(PIC)为0.289~0.369,并且该位点在3个品种中都处于哈迪-温伯格平衡状态;在与生长性状的关联分析中,该位点与福清山羊的尻宽和简阳大耳羊的体高、体长和胸围均显著相关(P<0.05),与简阳大耳羊的胸深、胸宽、管围、尻宽和管围指数极显著相关(P<0.01),并且II基因型个体显著优于DD基因型。本研究发现ITGAD基因InDel位点与山羊生长性状有显著的关联效应,为山羊生产性状的分子遗传标记选择提供参考依据。

来源:2022年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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