农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2022年第12期:拟苏尼特羊Lnc_000588的组织表达及其在调控肌肉生长发育中互作分子的预测

发布日期:

作者:宫文典, 王瑞雪, 王荣, 刘俊阳, 穆卿, 特日格勒, 吴子贤, 李蕴华, 刘佳森, 赵艳红

单位:1 内蒙古农业大学 动物科学学院/内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室,呼和浩特 010018; 2 内蒙古自治区农牧业科学院 畜牧研究所,呼和浩特 010031

关键词:长链非编码RNA (LncRNA),苏尼特羊,肌肉,靶基因,

基金:国家自然科学基金(31860628; 32160772; 31560624); 内蒙古自然科学基金(2020LH03020; 2015MS0381); 内蒙古科技计划项目(2020GG0031); 内蒙古农牧业科技创新基金(2017CXJJM01-3)

苏尼特羊(Ovis aries)是我国优质的肉羊资源,也是我国北方地区主要羊肉来源之一。长链非编码RNA (long non-coding RNA, LncRNA)在绵羊肌肉发育中发挥重要作用。为预测Lnc_000588在苏尼特羊骨骼肌发育中的调控网络,本研究对其在不同部位的组织表达量进行了实时荧光定量PCR分析及靶向miRNA-mRNA的生物信息学互作预测。同时,在小鼠(Mus musculus)成肌纤维细胞(C2C12)中检测了Lnc_000588的表达量。Lnc_000588在各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);Lnc_000588在C2C12细胞中的表达量随着细胞分化时间的延长而增加,48 h以后极显著高于较早时的表达(P<0.01)。;Lnc_000588可能通过miRNA参与调控肌肉的生长发育,其中的3个miRNA的靶基因富集于Ras信号通路(oas04014:Ras signaling pathway)、Rap1信号通路(oas04015:Rap1 signaling pathway)和AMPK信号通路(oas04152:AMPK signaling pathway)等66条通路。综上,Lnc_000588在苏尼特羊肌肉组织的表达量极显著高于其他组织,推测其参与了C2C12细胞分化。本研究为探究LncRNA参与苏尼特羊肌肉组织的调控功能提供了科学依据。

来源:2022年第12期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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