农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2021年第2期:基于RNA-seq技术挖掘杂交绵羊群体肌肉性状相关基因

发布日期:

作者:史金平, 马贵山, 张全伟, 刘婷, 童建伟, 孙鉴弘, 魏玉兵, 杨磊, 成述儒

单位:1 甘肃农业大学 动物科学技术学院,兰州 730070; 2 甘肃省天祝藏族自治县农业农村局,武威 733299; 3 甘肃农业大学 生命科学技术学院,兰州 730070; 4 甘肃省张掖市甘州区平山湖蒙古族乡畜牧兽医站,张掖 734000

关键词:绵羊,比较转录组,屠宰性能,肉质品质,商品代畜群,

基金:甘肃省甘肃农业大学学科建设基金(GAU-XKJS-2018-024); 农业行业专项-牧区极端条件下牛羊应急专用饲料的开发与示范(201303062-5)

肉质性能是影响绵羊(Ovis aries)养殖效益的主要经济性状,本研究旨在通过RNA-seq技术挖掘绵羊肉质品质相关基因,筛选优良商品代绵羊群体。以小尾寒羊(Small-tailed Han sheep, STH)母羊×萨福克(Suffolk sheep, SFK)公羊杂交一代(F1)商品代群体和小尾寒羊母羊(STH)×蒙古羊(Mongolian sheep, MG)公羊杂交一代(F1)商品代群体为研究对象,测定其屠宰性能和肉质品质,通过背最长肌转录组分析,挖掘影响绵羊肉质性状关键基因。结果显示,STH(♀)×SFK(♂)群体的屠宰性能和肉质品质均优于STH(♀)×MG (♂)群体。转录组结果显示,2个杂交群体背最长肌组织存在397个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),主要富集在生长、发育等46个基因本体(Gene Ontology, GO)项和磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidyl inositol-3-kinase, PI3K)、蛋白激酶B (protein kinase B, Akt)所组成的信号通路PI3K/Akt、氨基酸合成等26条通路。根据功能和通路分析,筛选脂联素基因(adiponectin, ADIPOQ)、胰岛素样生长因子结合蛋白7基因(insulin-like growth factor binding protein 7, IGFBP7)、心脏α肌动蛋白基因(actin α1, cardiac muscle, ACTC1) 3个基因作为肉质性状相关的候选基因。qRT-PCR结果显示,STH (♀)×SFK (♂)群体背最长肌中ADIPOQ和IGFBP7相对表达量显著高于STH×MG群体(P<0.01),而ACTC1表达量显著低于STH (♀)×MG (♂)群体(P<0.01)。本研究表明,STH×SFK群体在屠宰性能、肉质品质方面均优于STH×MG群体,经济效益明显。筛选获得的差异表达基因可作为改良绵羊肉质性状的候选基因。

来源:2021年第2期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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