农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2021年第5期:基于DIA技术的转IGF-I基因细毛羊皮肤组织蛋白组学分析

发布日期:

作者:张译元, 郭延华, 唐红, 高磊, 王新华, 周平, 王立民

单位:新疆农垦科学院 畜牧兽医研究所/省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,石河子 832000

关键词:转基因,胰岛素样生长因子-I (IGF-I),细毛羊,皮肤组织,数据非依赖性采集(DIA),蛋白质组学,

基金:国家转基因重大专项(2016ZX08008-001); 国家自然科学基金(31660341; 31760307)

转胰岛素样生长因子-I (insulin-like growth factor I, IGF-I)基因的中国美利奴细毛羊(Ovis aries)(以下简称转基因细毛羊),羊毛产量得到显著提高。为探明与羊毛产量相关的细毛羊皮肤蛋白的表达变化,本研究利用数据非依赖性采集(data-independent acquisition, DIA)蛋白组测序技术和生物信息学分析,对转基因细毛羊和野生型细毛羊的皮肤总蛋白进行分析,以期筛选获得与羊毛生长特性相关的特异性蛋白。首先应用DIA蛋白质组学和液相色谱串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)方法对转IGF-I基因细毛羊和野生型细毛羊皮肤组织进行蛋白质组测序,对测序数据进行归一化处理、差异表达蛋白分析、基因本体(Gene Ontology, GO)和KEGG富集分析以及候选蛋白质筛选。结果表明,共计筛选获得2 914个蛋白,差异表达蛋白930个,其中374个上调表达、556个下调表达,与羊毛性状相关的差异表达蛋白有18个;GO分析表明,生物学过程、分子功能、细胞组成相关的注释分别有24、14和18个;KEGG通路分析显示,差异表达蛋白涉及42条信号通路,其中丝氨酸/苏氨酸激酶、分泌型糖蛋白、促性腺激素释放激素、肿瘤抑制蛋白、转化生长因子β等8条信号通路可能与羊毛生长发育存在相关性。本研究对揭示差异表达蛋白与羊毛性状的关系有促进作用,为探明羊毛性状的分子调控机理及分子标记育种提供参考依据。

来源:2021年第5期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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