农业生物技术学报

作者：罗斌杰, 杨丽红, 李永, 谌颖莲, 赵佳福, 许厚强

单位：1 贵州大学 生命科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室 贵阳 550025; 2 贵州大学 生命科学学院,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳 550025; 3 贵州大学 生命科学学院,贵阳 550025; 4 贵州大学 动物科学学院,贵阳 550025; 5 贵州大学 医学院,贵阳 550025

关键词：长链非编码RNA (LncRNA),BLM解旋酶(BLM),前列腺癌,qRT-PCR,

基金：国家自然科学基金(31860242)

BLM解旋酶(bloom helicase, BLM)在DNA的复制、修复、重组以及维持端粒的稳定性等各方面都具有重要作用,当BLM解旋酶基因发生突变时,易患BLM综合征,甚至引发多种癌症。为探究BLM解旋酶基因相关长链非编码RNAs (long coding RNAs, LncRNAs)的表达规律,本研究以调控BLM基因相关的miR-27b-3p为关联点,利用自主开发程序SWChen2.3筛选与BLM基因相关LncRNAs,分析BLM相关LncRNAs在3种不同株系的前列腺癌细胞PC3、Lncap、22RV-1和正常人的前列腺基质成纤维细胞系WPMY-1中的表达情况。利用自主开发程序SWChen2.3筛选BLM基因相关的LncRNAs,对候选的LncRNAs进行克隆,并对其二级结构、ORF及其与BLM基因相关靶位点进行预测和分析。结果成功筛选NONHSAT203515.1 (GenBank No. m130127_152334_00126_c100)(命名为BLNC203)和(GenBank No. lnc-ZBTB201: 1)(命名为BLNC246)作为研究对象,采用qRT-PCR的方法检测BLNC203和BLNC246在3种不同前列腺癌细胞和正常上皮细胞系中的表达情况。qRT-PCR结果显示2条LncRNAs在不同前列腺癌细胞中均有表达,且各细胞间表达差异明显,BLNC203在PC3、22RV-1中的表达量都极显著高于正常细胞(P<0.01),在Lncap细胞中差异不显著(P>0.05)。BLNC246在PC3、Lncap细胞中表达量都极显著低于正常细胞(P<0.01),在22RV-1细胞中不显著(P>0.05)。BLNC203有3个ORF,BLNC246有1个ORF,BLNC203二级结构最小自由能为-239.10 kcal/mol,BLNC246的最小自由能为-85.30 kcal/mol。本研究结果将为进一步研究LncRNAs/BLM对前列腺癌细胞增殖的影响机制提供一定的理论依据。

来源：2021年第5期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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