农业生物技术学报

作者：刘凯, 冯晓宇, 吴燕琴, 储忝江, 谢楠

单位：1 杭州市农业科学研究院 水产研究所,杭州 310024;2 丽水市水产技术推广总站,丽水 323000

关键词：高体鳑鲏,线粒体基因组,测序,结构特征,

基金：杭州市农科院创新基金(2020HNCT-01; 2019HNCT-01)

高体鳑鲏(Rhodeus ocellatus)色彩艳丽、体型优美,是一种很有市场前景的观赏鱼。对高体鳑鲏线粒体基因组(mitochondrial genome, mtGenome)进行测序和分析、探讨不同地理群体高体鳑鲏的mtGenome差异以及高体鳑鲏在鱊亚科的系统发育地位,有利于高体鳑鲏的系统发育研究。本研究通过PCR扩增、测序、软件拼接等方法获得瓯江高体鳑鲏mtGenome (GenBank No. MW007386),长度为16 675 bp,碱基组成为A (28.98%)、G (17.09%)、C (26.51%)和T (27.42%),包含13个蛋白编码基因(protein-coding genes, PCGs)、22个tRNAs和2个rRNAs。瓯江高体鳑鲏mtGenome与PCGs的(A+T)含量分别为56.41%和56.27%,均具有明显的AT偏好性。在22个tRNAs中,除tRNA-Ser(AGY)外均可形成典型的三叶草结构。基于BLAST的比较表明,瓯江高体鳑鲏与东江高体鳑鲏的序列一致性为83.84%,与日本高体鳑鲏的序列一致性为95.07%,与GenBank No. DQ026430的高体鳑鲏序列一致性为93.11%,与图们江兴凯鱊(Acanthorhodeus chankaensis)序列一致性为99.03%,与黑龙江兴凯鱊序列一致性为83.72%,与沅江兴凯鱊序列一致性为83.84%。另外,瓯江高体鳑鲏与图们江兴凯鱊之间的遗传距离最近,与日本高体鳑鲏遗传距离次之,与东江高体鳑鲏则较远。基于25种隶属于3个属的鱊亚科鱼类mtGenome构建的系统进化树分析表明,瓯江高体鳑鲏与图们江兴凯鱊亲缘关系较近,而与东江高体鳑鲏亲缘关系较远。本研究为瓯江高体鳑鲏的遗传多样性保护与育种提供了参考依据。

来源：2021年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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