农业生物技术学报

作者：白佳灵, 王会, 钟金城, 陈智华, 柴志欣, 王吉坤, 王嘉博, 武志娟, 信金伟

单位：1 西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室/青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041;2 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室,拉萨 850000

关键词：西藏牛,三江牛,心脏组织,circRNA,低氧适应性,

基金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37); 四川省科技计划资助(2019YJ0257); 中央高校基本科研业务费专项基金项目(2020NGD03)

环状RNA (circle RNA, circRNA)是一种共价封闭的内源性生物分子,在高原动物低氧适应性中具有重要作用。高通量测序技术以成本低、通量高与速度快等优势,在哺乳动物与人类疾病研究中广泛应用,然而目前对西藏牛(Bos taurus)高原适应性相关circRNA的研究鲜有报道。本研究以西藏牛和三江牛为对象,选择对高原低氧环境敏感的心脏组织,使用Illumina HiSeqTM 4000平台对西藏牛与三江牛心脏组织circRNA进行测序,对其差异表达谱进行分析,并预测circRNA-miRNA-mRNA之间的靶向关系,构建circRNA-miRNA-mRNA可视化调控网络。在西藏牛和三江牛的6个样本中,共筛选得到差异表达circRNA 283个,其中显著上调的278个,显著下调的5个;GO功能富集分析显示,其来源基因被注释到45个功能条目;KEGG信号通路(pathway)功能富集分析表明,其来源基因主要显著富集在泛素介导的蛋白水解通路和cGMP-PKG信号通路等通路;novel_circ_018959与miR-142-x、miR-144-y、miR-1908-x、miR-2302-y、miR-1273-y等miRNA存在靶向关系,而这些miRNA的靶基因中包括ECE1、NFATC1、CAST、COX7C等低氧适应性候选基因,推测novel_circ_018959很可能参与西藏牛低氧适应性调控,其具体功能及调控机制有待进一步研究。本研究结果为深入揭示circRNA在西藏牛高原低氧适应过程中的分子机制提供了基础数据支持。

来源：2021年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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