农业生物技术学报

作者：刘志刚, 卢迈新, 曹建萌, 衣萌萌, 王淼, 高风英, 可小丽, 王广军

单位：中国水产科学研究院 珠江水产研究所/农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州 510380

关键词：鲤,稻渔共作,遗传多样性,线粒体DNA,核DNA,

基金：财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46);广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515010852);广州市科技计划项目(201904010304);广东省促进经济发展专项资金(现代渔业发展用途)项目(粤农2019B3)

鱼类遗传多样性与其环境适应能力和遗传进化潜能密切相关。为了了解我国华南地区稻田养殖鲤不同地理群体的遗传背景,通过PCR扩增细胞色素氧化酶Ⅰ (cytochrome oxidase subunit Ⅰ, COⅠ)-线粒体控制区(displacement loop region, D-loop)-内转录间隔区(internal transcribed spacer 1, ITS1)串联序列和序列比对,分析了4个鲤(Cyprinus carpio)群体(广东连南(LN), 广东乳源(RY), 广西金边鲤(JB), 广西三江(SJ))的遗传多样性和遗传结构。结果表明：COⅠ-D-loop-ITS1串联序列长度为1 842 bp,共检测到71个变异位点(包括28个单变异位点和43个简约信息位点)和33种单倍型,JB和RY群体的单倍型较多(各为11种),各群体间无共享单倍型。LN群体的单倍型多样性(haplotype diversity, Hd)最高(0.824),JB群体的核苷酸多样性(nucleotide diversity, Pi)最大(0.002 78),SJ群体的单倍型多样性和核苷酸多样性均为最低(Hd=0.662; Pi=0.000 56)。遗传差异分析结果表明,SJ与JB群体之间的遗传距离最小(0.004 6),LN与RY群体之间的遗传距离最大(0.008 7),各群体间遗传分化显著(FST (F-statistics)>0.25, P<0.01)。分子方差分析(analysis of molecular variance, AMOVA)结果表明,群体间变异占总变异的70.65%。个体系统进化树表明COⅠ-D-loop-ITS1序列能够将4个鲤鱼群体的个体完全区分开,优于单个基因的聚类效果。种群系统进化树中SJ与JB群体先聚为一小支,再与RY群体聚为一大支,而LN群体独立聚为一支。综上所述,4个稻田养殖鲤群体单倍型多样性较高,核苷酸多样性较低,群体间分化显著,应作为4个进化显著单元分别进行种质资源保护与利用。本研究揭示了我国华南地区4个稻田养殖鲤鱼群体的遗传结构和亲缘关系,丰富了稻田鲤鱼种群种质资源的基础资料,可为其种质保存、开发与利用奠定理论基础。

来源：2021年第7期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

查看农业生物技术学报杂志2021年第7期