农业生物技术学报

作者：唐靓婷, 黄世会, 王嘉福, 冉雪琴, 李升, 牛熙

单位：1 贵州大学 农业生物工程研究院/动物科学学院,贵阳 550025;2 贵州开放大学,贵阳 550023

关键词：从江香猪,网格蛋白介导的内吞作用(CME),缝隙连接(GJ),可变剪接,卵巢,

基金：国家自然科学基金(31960641; 31672390); 贵州省“百”层次创新型人才培养项目(黔科合人才(2016)4012号); 贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615); 贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2017]2585)

在卵巢卵泡发育过程中,卵母细胞与周围颗粒细胞之间形成缝隙连接通道,介导胞间通讯和物质转运,缝隙连接内在化可导致缝隙连接降解,是由网格蛋白介导的内吞过程(clathrin-mediated endocytosis, CME)。为了揭示CME对从江香猪(Sus scrofa)卵巢功能的调节作用,本研究以未发情期为对照,利用转录组测序技术,通过Limma、DESeq2和rMATS等软件以及逆转录PCR等技术,分析从江香猪发情期卵巢CME相关基因的表达和转录本发生的可变剪接。从江香猪卵巢中检测到8个CME基因表达,包括DAB衔接蛋白2 (DAB adaptor protein 2, DAB2),衔接蛋白复合体2亚基μ1 (adaptor related protein complex 2 subunit μ1, AP2M1), 网格蛋白轻链(clathrin light chain, CLT) A (CLTA)和B (CLTB), 动力蛋白1 (dynamin-1, DNM1), 肌球蛋白Ⅵ (myosin Ⅵ, MYO6),动力蛋白2 (dynamin-2, DNM2)和网格蛋白重链(clathrin heavy chain, CLTC),其中差异表达的基因有DAB2、AP2M1和CLTB;除了CLTB外,其余7个基因在发情和未发情卵巢之间发生差异的可变剪接,这些可变剪接产生的7个转录本是目前Ensembl数据库暂未收录的新转录本。说明可变剪接是从江香猪发情过程中卵巢功能重要的调控方式,以CME过程中产生新的转录本和蛋白的方式组建蛋白互作网络。结果表明,通过转录和转录后水平调控CME相关基因的表达和转录本的剪接,来影响缝隙连接的内在化,从而调节从江香猪卵巢的功能。本研究有助于提高对猪转录后调控过程的认识,对从转录组水平解析猪卵巢功能的分子调节机制具有重要意义。

来源：2021年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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