农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2021年第10期:伪狂犬病病毒Ⅱ型感染PK-15细胞的转录组学分析

发布日期:

作者:李海敏, 俞天奇, 金玉兰, 顾金燕, 周继勇

单位:浙江大学 动物医学中心/农业农村部动物病毒学重点实验室,杭州 310058

关键词:伪狂犬病病毒Ⅱ型(PRVⅡ),高通量测序,差异转录组,

基金:浙江省重点研发计划(2020C02011)

伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus, PRV)感染猪(Sus scrofa)可引起烈性接触性传染病,即伪狂犬病(Pseudorabies, PR),临床上主要通过疫苗免疫进行防控。PRV变异株(PRVⅡ型)的流行使传统疫苗失去有效保护。近年来出现PRV跨宿主感染人(Homo sapiens)的案例,更使PRV成为全球公共卫生威胁,但其感染致病机制仍不完全清楚。为从分子水平上全面了解PRV感染宿主细胞引起的变化,本研究以PRV Ⅱ型毒株PRV-DX感染猪肾细胞PK-15,通过高通量测序获得PRV感染后全部的细胞差异转录组数据,并对差异表达基因进行功能富集。结果表明,PRV-DX感染PK-15可引起3 595条基因表达上调、3 604条基因表达下调。通过qPCR验证随机选择的12条差异表达基因,其变化趋势与转录组数据一致。GO注释和KEGG信号通路富集将差异表达基因聚焦在代谢、基因表达、免疫等信号通路。本研究为深入解析PRV感染的致病机制提供了重要基础数据及研究方向。

来源:2021年第10期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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