农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2021年第11期:牛ATP10A基因组织特异性印记研究

发布日期:

作者:刘晓倩, 董艳秋, 靳兰杰, 谷书凯, 李冬杰, 李世杰

单位:1河北农业大学 生命科学学院,保定 071001;2河北科技大学 生物科学与工程学院,石家庄 050018

关键词:牛,PWS/AS印记区域,ATP10A (ATPase phospholipid transporting 10A),印记状态,DNA甲基化,

基金:国家自然科学基金(31372312); 河北省自然科学基金(C2020204004)

基因组印记是存在于哺乳动物中的一种重要的表观遗传修饰机制,与生物体的生长发育密切相关。ATP10A (ATPase phospholipid transporting 10A)基因位于PWS/AS印记区域的一端,该印记区域与人类(Homo sapiens)的PWS (Prader-Willi syndrome)综合征和AS (Angelman syndrome)综合征发生有关。ATP10A基因在人中表现为大脑特异性的印记基因,而在牛(Bos taurus)中的印记状态未见报道。本研究首先对32头牛心脏组织和15个牛胎盘基因组DNA进行PCR扩增,通过产物直接测序鉴定基因组中的单核苷酸多态位点,在牛ATP10A基因外显子20上鉴定出A/G杂合的SNP位点(rs136134264)。然后对杂合子牛各组织及胎盘总RNA进行RT-PCR,产物测序结果与上述杂合SNP位点进行对比,确定了ATP10A基因在牛大脑组织中为单等位基因表达,而在其他组织和胎盘中为双等位基因表达。进一步利用亚硫酸氢盐测序法,分析ATP10A基因启动子区在牛组织和胎盘中的DNA甲基化状态,发现所检测区域的46个CpG位点在牛组织和胎盘中均呈现轻甲基化状态,说明ATP10A基因启动子区的DNA甲基化修饰不参与调控ATP10A基因在牛中的印记表达。本研究可为深入探讨牛ATP10A基因功能和印记的分子机制提供参考依据。

来源:2021年第11期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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